产品

TruSight RNA Pan-Cancer Panel

靶向1385个癌症基因，用于多种RNA样本类型的基因表达、变异和融合检测研究，包括血液、骨髓和FFPE组织。

2.5天

分析时间

11小时

手动操作时间

10 ng总RNA，20-100 ng FFPE RNA

起始量

详情请参见规格表

MiniSeq系统可用的试剂和文库制备试剂盒套装

同时订购MiniSeq试剂和文库制备试剂盒，可节省更多成本，更加方便（货号 20005611）。

概述

TruSight RNA Pan-Cancer Panel可在台式测序系统上对有限和降解样本中的癌症相关RNA转录本进行深入且经济高效的评估。

  • 经过行业验证的内容，可全面查看与癌症通路相关的1385个基因

  • 全面了解癌症通路，可研究基因表达水平、变异和基因融合

  • 适用于大多数样本类型的低起始量实验方案，包括福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本

高效分析困难样本

文库只需10 ng总RNA起始量（或20 ng FFPE样本）即可制备。关注相关基因子集可以实现高灵敏度的RNA-Seq。

直观的云端数据分析

可以使用BaseSpace RNA-Seq Alignment App进行分析，该应用程序提供基因表达图谱、识别基因融合并报告单核苷酸变异和小插入缺失，为癌症研究人员提供全面、直观的解决方案。

样品数据集

注册或登录BaseSpace Sequence Hub，访问MiSeq系统数据和MiniSeq系统数据（查看运行或查看项目）。

性能参数

Cancer type Pan-Cancer, Hematologic, Solid Tumor
Method Target Enrichment, Targeted RNA Sequencing, Custom Sequencing
Specialized sample types Low-Input Samples, FFPE Tissue
Variant class Gene fusions, Transcript variants, Novel transcripts, Somatic variants
内容说明 具有1385个靶标基因和21,043个靶向外显子区域的泛癌panel。包括507个涉及癌症基因融合的基因。
分析时间 2.5天
手动操作时间 11小时
技术 Illumina测序
核酸类型 RNA
物种 人
系统 MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 500 Desktop Sequencer
自动化详情 探索可用的自动化方法
说明 对癌症相关RNA转录本开展全面评估，从而研究多种癌症类型的基因融合、变异和基因表达变化。
起始量 10 ng总RNA，20-100 ng FFPE RNA

所需产品

需要购买TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set A和/或B。每组包含文库制备试剂和寡核苷酸，用于48个样本，12个标签。每个标签足以用于4个单独的样本。两种试剂盒可同时用于混合多达24个样本。

如果使用MiniSeq系统，试剂和文库制备试剂盒可在TruSight Pan-Cancer Set A MiniSeq试剂盒中一起订购。

/

应用

TruSight RNA Pan-Cancer Panel可全面评估FFPE组织和其他肿瘤样本中的癌症相关RNA转录本和融合检测，用于研究。

工作流程示例

1
制备
2
测序
3
分析

项目建议

仪器 Recommended number of samples Read length
MiniSeq System

Samples per run: mid output: 2-3, high output: 8 (based on 3 million reads per sample)

2×75 bp（最大推荐值）
MiSeq System

8 samples per run with v3 reagents (based on 3 million reads per sample)

2×75 bp（最大推荐值）

相关应用和方法

泛癌分析

利用NGS进行泛癌分析可以全面评估与多种常见癌症相关的基因变异和异常，无论肿瘤来源是什么。

癌症RNA测序

利用RNA新一代测序（RNA-Seq）检测癌症基因表达和转录组变化，鉴定新的癌症转录本。

低质量/FFPE RNA-Seq解决方案

查找从降解的FFPE组织和其他低质量样本中获得高质量结果的FFPE RNA测序解决方案。

其他人如何使用该产品
儿童白血病癌症通路的新视图

文档

产品资料
Support documentation

比较

TruSight RNA Pan-Cancer Panel TruSight RNA Fusion Panel
Cancer type Pan-Cancer, Hematologic, Solid Tumor Pan-Cancer, Solid Tumor, Hematologic
Method Target Enrichment, Targeted RNA Sequencing, Custom Sequencing Target Enrichment, Targeted RNA Sequencing
Specialized sample types Low-Input Samples, FFPE Tissue Low-Input Samples, FFPE Tissue
Variant class Gene fusions, Transcript variants, Novel transcripts, Somatic variants Gene fusions
内容说明 具有1385个靶标基因和21,043个靶向外显子区域的泛癌panel。包括507个涉及癌症基因融合的基因。
分析时间 2.5天 2.5天
手动操作时间 11小时 11小时
技术 Illumina测序 Illumina测序
核酸类型 RNA RNA
物种 人 人
系统 MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 500 Desktop Sequencer MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 500 Desktop Sequencer
自动化详情 探索可用的自动化方法 探索可用的自动化方法
说明 对癌症相关RNA转录本开展全面评估，从而研究多种癌症类型的基因融合、变异和基因表达变化。

为癌症研究提供经济高效的NGS解决方案，深度覆盖涉及多种癌症类型的507个基因，包括实体瘤、肉瘤和血液恶性肿瘤。 
起始量 10 ng总RNA，20-100 ng FFPE RNA 10 ng总RNA，20-100 ng FFPE RNA

选择工具：

文库制备和芯片试剂盒选择器

寻找符合您需求的测序文库制备试剂盒或芯片。按方法、种类等筛选。比较、分享和订购试剂盒。

图

TruSight Pan-Cancer捕获化学技术

TruSight RNA PanCancer Panel提供了一种从总RNA中分离目标区域的简单、简化的方法。

鉴定新的基因融合伴侣

（A）Bioanalyzer上显示了来自黑色素瘤的3个不同FFPE样本的总RNA的大小分布。（B）表显示了当仅靶向融合对中的一个基因（突出显示）时，FFPE样本中基因融合伴侣的检测。

TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set A

RS-303-1002

包括用于48个样本的文库制备试剂和寡核苷酸，以及12个标签（每个标签足够用于4个单独样本）。与TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set B搭配使用时，最多能混合24个样本。

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set B

RS-303-1003

包括用于48个样本的文库制备试剂和寡核苷酸，以及12个标签（每个标签足够用于4个单独样本）。与TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set A搭配使用时，最多能混合24个样本。

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

TruSight RNA Pan-Cancer Set A MiniSeq Kit

20005611

包括用于48个样本的文库制备试剂和寡核苷酸，以及12个标签，外加6个MiniSeq High Output Kit（150个循环）。

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

Trusight RNA Pan-Cancer Oligo Panel

20046104

如果使用1重富集，Trusight RNA Pan-Cancer Oligo Panel包含足够用于测序的96个总RNA样本的寡核苷酸；如果使用3重*富集，则包含288个总RNA样本的寡核苷酸。此panel不包含文库制备。*仅适用于允许多重富集的文库制备工作流程。

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

显示 /

选择汇总

产品

数量

Unit Price

总 ( 商品)

您还没有选择任何商品

请在离开页面之前将这些产品添加到您的购物车，以免丢失。

常见问题解答

TruSight RNA Pan-Cancer工作流程包括六个主要步骤：

  • 生成链RNA-Seq文库
  • 将生物素化的探针与目标区域杂交
  • 使用链霉亲和素磁珠捕获靶标
  • 从磁珠中洗脱捕获的片段
  • 生成簇和测序
  • 使用BaseSpace RNA Alignment App分析数据和检出基因融合

了解更多。

这些探针旨在靶向1385个癌症基因，并通过覆盖每个基因的所有外显子来检测融合。

在MiSeq系统上运行RNA-Seq工作流程（仅FASTQ），并将数据流式传输到BaseSpace Sequence Hub。BaseSpace RNA-Seq Alignment App可分析TruSight RNA Pan-Cancer Panel的数据，提供包含融合表、变异表和基因表达表的简单结果摘要。您也可以使用自己的流程进行分析。

/

订购NovaSeq X系列

将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。

MiSeq Reagent Kit v3

与早期版本相比，优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。

TruSight Oncology 500

使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。

Illumina DNA Prep

快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。

NextSeq 500/550 v2.5 Kit

试剂v2.5试剂盒使用弹性流动槽，该流动槽可保持起始荧光强度，与早期版本相比提高了稳定性和性能。

MiSeq Reagent Kit v3

与早期版本相比，优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。

咨询专家

获取有关我们产品和服务的信息，或获得有关我们技术问题的答案。