BaseSpace Sequence Hub订购

在BaseSpace Sequence Hub中管理运行、分析、存储和共享测序数据。查找应用程序、订阅选项和文档。

概述

BaseSpace Sequence Hub(BSSH)是一款基因组学云计算软件,以用户友好的格式为研究人员提供简化的运行管理和直观的分析应用程序。BSSH通过提供以下产品,帮助不断增长和成熟的实验室扩展新一代测序(NGS)操作:

主要特点

  • 简化的运行规划和分析配置,减少手动操作

  • 开箱即用的分析应用程序,满足各种研究需求

  • 可扩展的存储空间,满足不断变化的实验室需求

  • 将测序数据高效转换为标准格式,并直接传输到云端

  • 立即共享数据并与同行合作

高效的运行设置、监控和分析

与所有因美纳测序系统集成,可实现一站式运行规划、分析配置和随时随地的实时运行监控。

简化的数据管理和存储

根据您的存储需求扩大或缩小规模——无需硬件维护或IT支持。存档数据,实现长期数据保留和优化的节省。

简化的数据分析

通过精选的90多个点击式基因组分析应用程序菜单提高生产力,包括DRAGEN、Illumina和第三方应用程序。


性能参数


合规性认证

应用

BaseSpace Sequence Hub提供了易于使用的分析应用程序,涵盖了与Illumina NGS数据一起使用的各种分析方法,包括RNA-Seq、外显子组/富集、扩增子、全基因组测序、 从头组装、16S宏基因组学等。

软件产品组合

1
实验室
2
运行

BaseSpace Sequence Hub

一体化的云端运行设置和监测。

3
分析
4
解读

相关应用和方法

计划和定价

BaseSpace Sequence Hub需要购买年度许可证和足够的iCredit,以满足基于通量的数据存储和分析需求。 

订阅选项

特点 基础版 专业版 企业版
包含存储空间 1 TB 1 TB 1 TB
免费积分(包括iCredit的鼠标悬停定义“1个iCredit等于1.00美元” 250* iCredit 500个iCredit 500个iCredit
付款计划 N/A 每月账单或预付iCredit 每月账单或预付iCredit
运行设置和监控
 
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FASTQ 生成 免费 免费 免费
数据输出 免费 免费 免费
数据共享
 
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高级安全性和合规性(加密、ISO 27001和ISO 27701认证、ISO 13485合规)
 
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API和命令行访问
 
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用户数量 一组 无限制 无限制
工作组   一组 无限制
高级安全(私有域、单点登录**、审计跟踪、访问控制)    
 
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HIPAA业务伙伴协议(BAA)支持(仅限美国)    
 
复选标记
服务水平协议    
 
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* 250个iCredit会在30天的入门试用期后过期。 
**适用于安装了支持Universal Copy Service的控制软件的系统。不适用于所有传统系统。

在BaseSpace Sequence Hub中处理一个样本的成本是多少?

应用 成本 详情
人类全基因组测序 7个iCredit

样本:30× hWGS

大小:120 Gb

应用程序:DRAGEN Germline

输出:VCF、BAM/CRAM

外显子组测序 2个iCredit

样本:外显子组

大小:100 Gb

应用程序:DRAGEN Germline

起始量:FASTQ

输出:VCF、BAM/CRAM

癌症panel 2个iCredit

样本:骨髓panel

大小:50 Mb

应用程序:DNA Amplicon

起始量:FASTQ

输出:体细胞变异

转录组 2个iCredit

样本:RNA-Seq

大小:50M Read

应用程序:DRAGEN RNA

起始量:FASTQ

输出: 融合、转录本

差异表达 1 iCredit

样本:肿瘤外显子组

大小:10 Gb

应用程序:RNA-Seq Differential Expression

起始量:FASTQ

输出:体细胞变异

RNA panel 2个iCredit

样本:RNA panel

大小:300万条read

应用程序:RNA扩增子

起始量:FASTQ

输出: 体细胞变异

16S rRNA 1-2 iCredit

样本:16S Metagenomics

应用程序: 16S宏基因组学

起始量:FASTQ

输出:物种分类

BaseSpace Sequence Hub dashboard

直观的BaseSpace Sequence Hub仪表板

一目了然地查找有关最新运行和分析的通知、状态更新和信息。 

bssh monitor in real-time

实时监控数据

BaseSpace Sequence Hub用户界面内置了Sequence Analysis Viewer(SAV)功能,可实现实时、逐个循环的监控。图表视图显示了每个通道和每个循环的数据,以及Q值分布和热图特征。每张图都可以扩展成全尺寸。

basespace analytical tools dashboard

按需启动分析工具

在BaseSpace Apps Store中浏览并探索越来越多的DRAGEN和Illumina应用程序,并直接从数据集中单击即可启动选定的应用程序。

individual and working group basespace hub

个人和工作组账户

使用个人凭据登录BaseSpace,然后在个人账户和工作组账户之间切换。在工作组帐户中,您可以查看工作组共有的所有运行和分析,也可以使用工作组购买的存储和计算时间,如不同的仪表板所示。

了解BaseSpace示例数据集

查看BaseSpace Sequence Hub中多种方法的样本数据集,或者试用感兴趣的应用程序并交互评估结果。

查看样本数据集

相关资源

缩略图

BaseSpace Sequence Hub:更好地合作

观看BaseSpace Sequence Hub简介,了解如何轻松存储和分析基因组数据。

了解最新的信息学产品发布、版本更新和特色亮点。

获取旨在帮助新用户开始使用BaseSpace Sequence Hub的资源汇编。

加速冠状病毒检测和鉴定,进行宿主反应研究,简化样本追踪,并为公共数据库做出贡献。

软件和信息学选项 (2)

BaseSpace Sequence Hub Professional Annual Subscription

20042109

专业级BaseSpace Sequence Hub年度订阅。专业级提供500个iCredit(用于快速开始使用BaseSpace应用程序和存储数据)、1个工作组(用于加强协作)以及对功能强大的API的访问权限。

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BaseSpace Sequence Hub Enterprise Annual Subscription

15066411

BaseSpace Sequence Hub Enterprise的年度订阅。此订阅支持多个工作组、私有域、单点登录和HIPAA合规性(仅限美国)。

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数据分析和存储 (6)

Illumina Analytics - 1 iCredit

20042038

iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。

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Illumina Analytics  Starter Pack - 1,000 iCredits

20042039

iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。

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Illumina Analytics  - 5,000 iCredits

20042040

iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。

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Discounts:

Illumina Analytics  - 50,000 iCredits

20042041

iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。

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Illumina Analytics - 100,000 iCredits

20042042

iCredit用于在BaseSpace Sequence Hub或Illumina Connected Analytics上进行的数据存储和分析。

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Illumina Analytics Consumption Billing

20012931

未超出的金额表示为报价中的金额。每月向客户开具发票,收取计算、储存和第三方App费用,最高金额与货号20012931相关。

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常见问题解答

可以,30天免费试用,在您首次创建帐户并登录时会自动开始。该试验提供250个iCredit(30天后到期),可用于计算任何BaseSpace应用程序的费用和>1 TB的数据存储。30天后,您可能不再运行应用程序,但仍可以监控测序运行、对上传的运行进行样本拆分、存储有限量的数据、与合作者共享和传输以及下载数据。

iCredit是用于购买Illumina基因组数据存储和分析选项的货币。需要购买iCredit才能运行数据分析应用程序并将数据存储在BaseSpace Sequence Hub中。深入了解BaseSpace Sequence Hub的iCredit和账单

Illumina致力于保护客户数据的机密性和安全性。所有数据共享均由客户或其代理控制。Illumina使用基于角色的访问控制来禁止未经授权的数据访问,并每年审计基于角色的访问权限授权。

Illumina为BaseSpace Sequence Hub用户提供了广泛的支持。支持文档、培训和其他资源可在 BaseSpace开发人员网站 和 BaseSpace支持部分获取。您也可以联系技术支持。

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订购NovaSeq X系列

将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。

MiSeq Reagent Kit v3

与早期版本相比,优化的试剂盒可增加簇密度和读长,从而提高测序质量分值。

TruSight Oncology 500

使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征(TMB、MSI和HRD)的大型泛癌panel实现CGP。

Illumina DNA Prep

快速、集成的文库制备工作流程,适用于各种测序应用。

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