检测癌症转录组中的变化

RNA-Seq提供了关于癌症基因表达以及推动肿瘤进展的基因融合的功能信息

癌症RNA测序

利用癌症RNA测序(RNA-Seq)监测基因表达和转录组变化有助于了解肿瘤的分类和进展。癌症积累了许多遗传变化,但通常只有少数变化会推动肿瘤进展。癌症RNA-Seq可帮助科学家:

  • 确定癌症样本中表达的变异
  • 鉴定与各个肿瘤、单细胞和肿瘤类型相关的基因表达特征和突变谱
  • 关注具有明确功能影响的体细胞突变,并鉴定关键的癌症驱动性突变
  • 发现新的调控基因表达的小RNA
  • 鉴定染色体易位引起的基因融合
Oncology

对编码区或整个癌症转录组进行测序可以提供有关肿瘤基因表达变化的重要信息。癌症RNA-Seq能够检测链特异性信息,这是基因调控的重要组成部分。癌症转录组测序能同时捕获编码R和非编码RNA,并为完整的表达动态视图提供链方向。

深入了解RNA-Seq

靶向RNA扩增子测序能分析特定癌症基因的表达。预设计的癌症基因表达panel专注于p53和NFκB等相关通路。研究人员可以添加定制内容来扩大实验范围。

深入了解靶向RNA-Seq

癌症RNA-Seq研究案例

用于精准肿瘤学研究的癌症RNA-Seq
用于精准肿瘤学研究的癌症RNA-Seq

Avera Health的临床研究人员借助新一代测序揭示了多药物敏感性致瘤通路。

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揭示长链非编码RNA在癌症中的作用
揭示长链非编码RNA在癌症中的作用

研究人员正在使用RNA-Seq来揭示如何利用lncRNA来识别、测量和治疗癌症。

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Exploring the Genetic Basis of Oral Cancer
探索口腔癌的遗传基础

印度的研究人员正在使用RNA-Seq和其他方法来研究可能影响一种致命口腔癌的变异。

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缺失或扩增的miRNA位点所在的基因组区域已经与多种形式的癌症相关联。小RNA-Seq可以发现和分析癌症转录组中存在的miRNA和其他非编码小RNA。

深入了解小RNA-Seq

福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)肿瘤样本中可能包含有关癌症发病机理和结果的重要信息。FFPE样本中通常含有部分降解的RNA,因此,对其进行癌症RNA-Seq可能会面临挑战。新一代RNA-Seq方法能让研究人员获得这些重要数据,并从降解的RNA和FFPE来源的RNA中获得高质量结果。

深入了解FFPE RNA-Seq
肿瘤微环境分析

NGS可以对肿瘤基因组进行细致的分析,有效地评估肿瘤微环境,以此来实时且高度灵敏地监测免疫系统对肿瘤生长或治疗的反应,监测免疫标记的表达。

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Tumor cell and immune system
癌症研究和分子生物学中的单细胞多组学

教授们讨论了他们如何利用新出现的单细胞测序技术捕获转录组、表观基因组、表观转录组和蛋白组,研究肿瘤异质性、癌症进展等。

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肿瘤免疫分析鉴定胶质母细胞瘤靶标

来自MD Anderson癌症中心Padmanee Sharma博士实验室的Swetha Anandhan重点介绍了利用单细胞RNA-Seq鉴定CD73是胶质母细胞瘤中的组合靶标。

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表征非编码癌症基因组

将DNA测序和RNA测序以及其他技术结合,可帮助确定非编码区域中癌症突变的功能影响。

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用RNA-Seq定量肿瘤中的免疫环境

通过将RNA测序和图像数据的分析结合,Zlatko Trajanoski教授的实验室设计了一个强大的工作流程,实现免疫肿瘤学发现。

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推动单细胞研究

Weizmann研究所的研究人员使用DNA、RNA和表观遗传学测序方法研究免疫系统细胞如何与健康组织和肿瘤细胞相互作用。

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乳腺癌的遗传学

Lund大学的Åke Borg博士讨论了基于基因表达模式、DNA甲基化、核苷酸取代和基因组重排的乳腺癌亚型分类。

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Illumina为癌症RNA-Seq提供了多种文库制备、测序和数据分析选项。一体化的文库制备工作流程和灵活的试剂盒配置适合多种研究设计。Illumina系统提供业界领先的数据质量——事实上,全世界约90%的测序数据是用Illumina边合成边测序(SBS)技术产生的。

BaseSpace Sequence Hub中的一键式应用软件简化了数据分析,这样,您就可以减少花在数据分析上的时间,将更多的时间用于下一次的突破。

点击下方的查看工作流程各步骤所使用的产品。

TruSight RNA Pan-Cancer

靶向1385个肿瘤基因,可用于包括FFPE在内的所有RNA样本类型的基因表达、变异和融合检测。

TruSight Tumor 170

检测导致实体瘤进展的单核苷酸位点变异(SNV)、扩增以及融合的全面panel。

TruSeq RNA Exome

可重现且经济的编码RNA测序方法,适用于FFPE样本和其他低质量样本。

AmpliSeq for Illumina Custom RNA Fusion Panel

用于检测融合基因和测定基因表达的可定制靶向panel。

TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit

精确测量mRNA链方向,用于检测反义转录,发现替代转录本、基因融合和等位基因特异性表达。

TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kit

可扩展的全转录组分析解决方案,可为完整的转录组视图提供准确的链信息。

TruSeq Small RNA Library Prep Kit

用于microRNA分析的灵敏试剂盒。

AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panel

优化的靶向定制RNA研究panel,可测序多达1200个感兴趣的靶点。

MiniSeq系统

最简单、最实惠的低通量靶向基因表达图谱分析解决方案。

MiSeq系统

桌面式测序仪,NGS工作流程简单、整合数据分析软件,具有无可匹敌的准确性。

NextSeq 550系统

灵活的桌面式测序系统,适用于各种癌症RNA-Seq应用,包括全转录组分析和癌症基因表达图谱分析。

NextSeq 1000和2000系统

突破性的台式测序仪让您能够以更高的效率和更少的限制探索当前和新兴应用中的新发现。

NovaSeq 6000系统

无论何种基因组、何种测序方法和项目规模都有可扩展的通量,灵活简便。

DRAGEN RNA Pipeline

进行比对、定量和融合检测。

RNA-Seq Differential Expression

实现差异基因表达分析。

MiSeq Reporter

MiSeq系统上简便易用的软件,可用于分析和变异检出。

DRAGEN Bio-IT Platform

能对RNA-Seq数据等测序数据进行准确的超快速二级分析。

BaseSpace Correlation Engine

不断增长的经审核的基因组数据库,可在鉴定疾病机制、药物靶点、预后和预测性生物标记方面为研究人员提供有力支持。

药物反应的RNA生物标记

RNA测序(RNA-Seq)被越来越多地用于发现和分析基于RNA的药物反应生物标记。

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药物反应的RNA生物标记
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用于癌症转录组分析的RNA-Seq 

了解用于单个癌细胞转录组分析的RNA-Seq。

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FFPE RNA 测序
FFPE RNA-Seq

新一代RNA-Seq方法能让研究人员从降解的样本和FFPE来源的样本中获得有价值的数据。

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通过整合基因组学来提供癌症预后信息
通过整合基因组学来提供癌症预后信息

结合DNA和RNA数据的分子分析可以更轻易地鉴定出潜在的癌症驱动基因。

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NextSeq 1000和NextSeq 2000单细胞RNA测序解决方案

这一经济高效、灵活的工作流程可测量单细胞中的基因表达,并提供高分辨率的分析,从而发现通常被批量采样方法掩蔽的细胞间差异。此应用说明简介了工作流程,提供研究设计示例和通量表等信息。

阅读应用说明