用于NGS的LIMS

基因组学实验室NGS LIMS和样本追踪解决方案

仪器整合和NGS专用功能有助于部署和优化

NGS LIMS的优势

LIMS(实验室信息管理系统)专为基因组学设计,并针对新一代测序(NGS)优化,可帮助快速准确地管理和解读测序数据。高通量和复杂的基因组学研究——无论是用NGS还是其他测序技术,都需要整合其他实验室系统并能管理庞大样本量的LIMS。

NGS实验室遭遇的瓶颈和挑战往往是管理和解析测序数据,而不是成本和技术缺乏。由于高通量NGS成本较低且更易获得,几乎所有实验室都能使用这项技术。在此类环境中使用LIMS管理和测序样本能提高效率和准确性。

要寻找的NGS LIMS关键功能

以下是部署用于NGS或其他复杂基因组研究的LIMS时应考虑的一些功能:

  • 完整的样本追踪——在整个工作流程中使用样本编号和试剂条形码验证和追踪样本
  • 工作流程自动化——可用于常规任务,降低出错风险
  • 预设工作流程和即装即用的整合功能——有利于NGS工作流程的实施
  • 可配置和定制的工具——根据不断演变的需求修改工作流程
  • 合规支持——用于具有诸如审计追踪和电子签名的监管环境
  • 可扩展性——使实验室可以根据不断变化的需求调整样本通量
  • 适用于不同的用户类型——将界面设置为仅访问与每个实验室成员相关的信息,减少成员浏览不必要的任务所花费的时间
  • 几乎不需要供应商干预——因此实验室可以快速地设置、运行并获得结果

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整合用于NGS和基因组工作流程的仪器

许多实验室惊讶地发现,投资测序仪器只是进行新一代测序所需的一部分。其他实验室工具,例如qPCR仪器、自动液体处理系统以及核酸质量控制和定量系统,都是日常标配。如果有整合这些工具,能实现某些实验室功能自动化,并能启动其他过程或下游分析的LIMS,进行复杂的基因组研究、大规模研究或NGS研究会变得更简单。

专为基因组学设计、并针对NGS进行了优化的LIMS

BaseSpace Clarity LIMS是专为各种规模的基因组学实验室设计、并针对NGS研究优化的系统。BaseSpace Clarity LIMS帮助实验室在整个测序工作流程中追踪样本,简化实验室操作,并通过与Illumina和其他常见实验室仪器的整合快速开始。

了解关于BaseSpace Clarity LIMS的更多信息
构建vs.购买LIMS

初次使用LIMS的实验室为什么选择购买市售LIMS用于NGS及其它基因组学应用。

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Business and operational reasons that make a well-built commercial LIMS (one that's specifically tailored for NGS and genomics) a smarter investment than building a system from scratch include:

  1. Provides scale to keep cutting-edge labs on pace
  2. Expedites lab setup and production
  3. Improves results with sample traceability
  4. Manages workflows to improve lab efficiency
  5. Supports faster publishing

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LIMS加速NGS研究的五种方法

与从头开始构建系统相比,构建良好的商业LIMS(为NGS和基因组学量身定制的LIMS)是一项更明智的投资,其中的业务和运营原因包括:

  1. 提供可以紧跟顶尖实验室步伐的规模
  2. 加速实验室的设置和结果生成
  3. 通过样本可追溯性改善结果
  4. 管理工作流程,提高实验室效率
  5. 帮助实验室更快发表成果

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