AmpliSeq for Illumina信息学解决方案
用户友好的扩增子数据分析
使用我们用于AmpliSeq for Illumina Panel的完整信息学解决方案，以简单方式处理原始测序数据，并得到有意义的结果。分析功能专为生物学家设计，不需要专用的计算基础设施或生物信息学专业知识。
最终将产生包含变异详细信息和生物学解读的有意义的报告。提供用于DNA和RNA扩增子panel的信息学解决方案。
- 对于DNA扩增子panel，二级分析工作流程将比对read和参考基因组，并检出变异。
- 对于RNA扩增子panel，二级分析工作流程将进行差异表达分析和基因融合检出。
- 高级分析根据经审核的公开和私有知识库，为变异、基因融合和差异表达基因加入生物学意义。
主要的AmpliSeq信息学工具
一旦完成机载分析，BaseSpace Sequence Hub和Local Run Manager将生成扩增子panel的变异检出和差异表达结果。
BaseSpace Sequence Hub
设置并实时监测仪器运行，使用一组经审核的分析应用程序对数据进行管理和分析：
- 测序数据从仪器直接传输到云端
- 将数据转换为标准格式
- 比内部组装基础设施和工具更经济
Local Run Manager
机载解决方案，用于创建测序运行、监测运行状态、分析测序数据和查看结果：
- 自动进行机载数据分析
- 使用可选的软件模块为不同文库类型执行分析程序
进一步，Basespace Variant Interpreter和BaseSpace Correlation Engine可以为您的结果加入生物学背景并生成报告。
BaseSpace Variant Interpreter
快速识别人类基因组数据中生物学上有意义的变异：
- 使用多种来源注释数据，将发现的结果汇总到结构化报告中
- 分析从全基因组测序到靶向测序的多种检测类型中的变异
- 使用超过60,000个经人工审核的关联来加快变异解读。
BaseSpace Correlation Engine
由数据驱动发现实验、药物和表型相关的的基因及感兴趣的变异：
- 识别疾病机理、药物靶标和预后性或预测性生物标记
- 通过多种研究和数据类型查看在疾病发展中具有重要作用的通路
- 分析药物动力学和毒性特性的候选分子