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信息学专业服务
20071787
TruSight Oncology 500 ctDNA v2是一种泛癌种NGS检测方法,可对血浆中的循环肿瘤DNA(ctDNA)进行全景变异分析(CGP),以供研究。
2024年将兼容NovaSeq 6000、NovaSeq 6000Dx(RUO模式)和NovaSeq X!
低水平的生物标志物检测
使用基于UMI的杂交捕获文库制备和深度测序技术,以低起始量(20 ng)实现灵敏、准确的检测(SNV为0.2% VAF)。
集成生物信息学分析
DRAGEN二级分析通过Illumina Connected Analytics在本地或云端提供支持,实现快速变异检出。通过Illumina Connected Insights*或Velsera使用集成报告功能获取见解。
一体化的工作流程
先进的化学技术和广泛的工作流程优化可在一天内完成文库制备和富集,总周转时间小于4天。支持自动化的试剂盒和方法可以提高效率。†
*仅在部分国家/地区上市。Illumina Connected Insights通过对第三方知识库的API调用,支持用户自定义的三级分析。
†2024年第一季度将推出支持自动化的试剂盒
因美纳使用TruSight Oncology ctDNA 500 v2改进了循环肿瘤的分析。观看视频,了解新功能和优势。
利用TruSight Oncology 500产品系列大幅提高可干预变异的识别率。
用于分析血浆中的循环肿瘤DNA(ctDNA),其DNA panel内容与TruSight Oncology 500相似。
评估FFPE肿瘤组织中的相关DNA和RNA癌症生物标志物(现可通过配套试剂盒支持检测HRD),可评估基因组不稳定性评分(GIS)†
使用与TruSight Oncology 500相同的panel内容和组织起始量时,一次最多可批量处理192个样本。
†HRD检测功能需要在TruSight Oncology 500试剂盒中额外使用TruSight Oncology 500 HRD试剂盒。暂未在日本推出。
仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
---|---|---|
NovaSeq 6000 System | 每次运行24个样本(S4流动槽),800 M双端read,35,000×覆盖度 | 2 × 150 bp |
NovaSeq 6000 System | 每次运行8个样本(S2流动槽),800 M双端read,35,000×覆盖度 | 2 × 150 bp |
TruSight Oncology 500 ctDNA v2 | TruSight Oncology 500 | TruSight Oncology 500 High-Throughput(大样本量方案) | |
---|---|---|---|
变异种类 | 单核苷酸位点变异 (SNV), 拷贝数变异 (CNVs), 插入缺失 (indels) | 单核苷酸位点变异 (SNV), 转录变异, 基因融合, 拷贝数变异 (CNVs), 插入缺失 (indels) | 单核苷酸位点变异 (SNV), 转录变异, 基因融合, 拷贝数变异 (CNVs), 插入缺失 (indels) |
技术 | 测序 | 测序 | 测序 |
方法 | 靶向富集, 靶向DNA测序 | 靶向RNA测序, 靶向富集, 靶向DNA测序 | 靶向RNA测序, 靶向富集, 靶向DNA测序 |
核酸类型 | DNA | RNA, DNA | RNA, DNA |
物种类别 | 人类 | 人类 | 人类 |
特殊的样本类型 | Circulating Tumor DNA, 血液 | FFPE组织 | FFPE组织 |
癌症类型 | 泛癌种, 实体瘤 | 泛癌种 | 泛癌种 |
系统兼容性 | NovaSeq 6000 | NextSeq 550Dx in Research Mode, NextSeq 500, NextSeq 550 | NovaSeq 6000 |
* 基于Pierian临床知识库,截至2023年2月。
* 在RUO模式下,NovaSeq 6000Dx系统需要使用单独的独立DRAGEN服务器进行二级分析。
* 2024年兼容NovaSeq X和NovaSeq 6000 Dx
Simplifying the process to identify applicable variants in oncology samples
Brochure | PDF 2 MB
Liquid Biopsy and NGS: Driving translational clinical research to the next level
Application Note | PDF < 1 MB
Technical Note | PDF | 2 versions
TruSight Oncology 500 ctDNA Gene List
product_file | EXCEL < 1 MB
Data analysis and reporting for the TruSight Oncology 500 portfolio
Product Information Sheet | PDF 1 MB
Using lower input amounts with TruSight Oncology ctDNA v2
Technical Note | PDF < 1 MB
Data Sheet | PDF | 7 versions
Data Sheet | PDF | 3 versions
TruSight Oncology 500 ctDNA Local App Documentation
DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA v1.1 Local Analysis Software Documentation
DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA Analysis Software v1.2 Documentation
DRAGEN Analysis Workflows Product Documentation
DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA Analysis Software v2.1.1 on ICA Documentation
TruSight Oncology 500 ctDNA Consumables & Equipment Documentation
TruSight Oncology 500 ctDNA Support Documentation
TruSight Oncology 500 ctDNA Checklist Documentation
DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA Analysis Software v1.2 on ICA Documentation
DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA Local Analysis Software v2.1 Documentation
TruSight Oncology 500 ctDNA Analysis Software Documentation