TruSight Oncology 500 ctDNA v2

使用能够检测血浆中ctDNA的关键IO基因特征(TMB、MSI)以及所有主要变异类别的泛癌panel进行CGP分析。 阅读更多...

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Library Prep

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 (24个样本)

20105899

TruSight Oncology 500 ctDNA v2,配合NovaSeq 6000 S2流动槽使用(24个样本)

20105901

TruSight Oncology 500 ctDNA v2,配合NovaSeq 6000 S4流动槽使用(24个样本)

20105902

TruSight Oncology 500 ctDNA v2(24个样本),外加Velsera解读报告

20105905

TruSight Oncology 500 ctDNA v2,外加Velsera解读报告,配合NovaSeq 6000 S2流动槽使用(24个样本)

20105907

TruSight Oncology 500 ctDNA v2,外加Velsera解读报告,配合NovaSeq 6000 S4流动槽使用(24个样本)

20105908

TruSight Oncology 500 ctDNA Kit (48个样本)

20039252

TruSight Oncology 500 ctDNA Kit ,外加Velsera解读报告(16个标签,48个样本)

20043410

TruSight Oncology 500 ctDNA Kit ,配合NovaSeq 6000 S2使用

20101995

TruSight Oncology 500 ctDNA Kit,配合NovaSeq 6000 S4使用

20101998

TruSight Oncology 500 ctDNA Kit,配合NovaSeq 6000 S2使用,外加Velsera解读报告(16个标签,48个样本)

20102000

TruSight Oncology 500 ctDNA Kit,配合NovaSeq 6000 S4使用,外加Velsera解读报告(16个标签,48个样本)

20102001


Index Adapters

IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set A, Ligation (96个标签,96个样本)

20034701

IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set B, Ligation(96个标签,96个样本)

20034702


Reagents

NovaSeq 6000 S2 Reagent Kit v1.5(300个循环)

20028314

NovaSeq 6000 S4 Reagent Kit v1.5 (300个循环)

20028312


Software and Informatics Options

Illumina DRAGEN Server v4

20051343

ICA基础版年度订阅

20044874

ICA专业版年度订阅

20044876

ICA企业版年度订阅

20038994

ICA企业版服务和合规性附加组件(仅适用于基础版)

20066830

Illumina Analytics - 1 iCredit

20042038

Illumina Analytics  Starter Pack - 1,000 iCredits

20042039

Illumina Analytics  - 5,000 iCredits

20042040

Illumina Analytics  - 50,000 iCredits

20042041

Illumina Analytics - 100,000 iCredits

20042042

Illumina Connected Insights–年度订阅

20090137

Illumina Connected Insights——肿瘤学基因组等效样本-VCF

20090138

Illumina Connected Insights——培训和入门

20092376

信息学专业服务

20071787

产品特色

TruSight Oncology 500 ctDNA v2是一种泛癌种NGS检测方法,可对血浆中的循环肿瘤DNA(ctDNA)进行全景变异分析(CGP),以供研究。

  • 利用微创血液样本作为组织活检的补充或替代选择
  • 靶向523个基因以评估主要变异类别(SNV、MNV、插入缺失、CNV和基因重排)中的DNA变异,以及关键免疫肿瘤学基因特征(TMB、MSI)
  • 以更少的cfDNA起始量实现超灵敏检测
  • 简化的工作流程在4天内即可从cfDNA中获取最终报告

2024年将兼容NovaSeq 6000、NovaSeq 6000Dx(RUO模式)和NovaSeq X!

低水平的生物标志物检测

使用基于UMI的杂交捕获文库制备和深度测序技术,以低起始量(20 ng)实现灵敏、准确的检测(SNV为0.2% VAF)。

集成生物信息学分析

DRAGEN二级分析通过Illumina Connected Analytics在本地或云端提供支持,实现快速变异检出。通过Illumina Connected Insights*或Velsera使用集成报告功能获取见解。

一体化的工作流程

先进的化学技术和广泛的工作流程优化可在一天内完成文库制备和富集,总周转时间小于4天。支持自动化的试剂盒和方法可以提高效率。

*仅在部分国家/地区上市。Illumina Connected Insights通过对第三方知识库的API调用,支持用户自定义的三级分析。

2024年第一季度将推出支持自动化的试剂盒

TruSight Oncology ctDNA 500 v2

因美纳使用TruSight Oncology ctDNA 500 v2改进了循环肿瘤的分析。观看视频,了解新功能和优势。

通过全面的产品组合实现CGP

利用TruSight Oncology 500产品系列大幅提高可干预变异的识别率。

TruSight Oncology 500 ctDNA v2

用于分析血浆中的循环肿瘤DNA(ctDNA),其DNA panel内容与TruSight Oncology 500相似。

TruSight Oncology 500

评估FFPE肿瘤组织中的相关DNA和RNA癌症生物标志物(现可通过配套试剂盒支持检测HRD),可评估基因组不稳定性评分(GIS)

TruSight Oncology 500 High-Throughput(大样本量)检测

使用与TruSight Oncology 500相同的panel内容和组织起始量时,一次最多可批量处理192个样本。

HRD检测功能需要在TruSight Oncology 500试剂盒中额外使用TruSight Oncology 500 HRD试剂盒。暂未在日本推出。

brochure Illumina TSO 500 Portfolio cover

TSO 500产品系列介绍手册

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经常一并购买

规格

计划推荐

仪器 推荐的样本数 读长
NovaSeq 6000 System 每次运行24个样本(S4流动槽),800 M双端read,35,000×覆盖度 2 × 150 bp
NovaSeq 6000 System 每次运行8个样本(S2流动槽),800 M双端read,35,000×覆盖度 2 × 150 bp

产品比较

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 TruSight Oncology 500 TruSight Oncology 500 High-Throughput(大样本量方案)
变异种类 单核苷酸位点变异 (SNV), 拷贝数变异 (CNVs), 插入缺失 (indels) 单核苷酸位点变异 (SNV), 转录变异, 基因融合, 拷贝数变异 (CNVs), 插入缺失 (indels) 单核苷酸位点变异 (SNV), 转录变异, 基因融合, 拷贝数变异 (CNVs), 插入缺失 (indels)
技术 测序 测序 测序
方法 靶向富集, 靶向DNA测序 靶向RNA测序, 靶向富集, 靶向DNA测序 靶向RNA测序, 靶向富集, 靶向DNA测序
核酸类型 DNA RNA, DNA RNA, DNA
物种类别 人类 人类 人类
特殊的样本类型 Circulating Tumor DNA, 血液 FFPE组织 FFPE组织
癌症类型 泛癌种, 实体瘤 泛癌种 泛癌种
系统兼容性 NovaSeq 6000 NextSeq 550Dx in Research Mode, NextSeq 500, NextSeq 550 NovaSeq 6000

基于Pierian临床知识库,截至2023年2月。

在RUO模式下,NovaSeq 6000Dx系统需要使用单独的独立DRAGEN服务器进行二级分析。

2024年兼容NovaSeq X和NovaSeq 6000 Dx

具体的方法工作流程范例

 

常见问题

TruSight Oncology 500 ctDNA v2是一款超灵敏、一体化的实体瘤液体活检产品,可在4天内获得血浆样本的全景变异分析(CGP)结果,而TruSight Oncology 500和TruSight Oncology 500 High-Throughput(大样本量方案)则可实现对组织样本的CGP。请参阅TruSight Oncology检测比较表,了解其他不同之处。

TruSight Oncology 500 ctDNA v2分析工作流程使用在DRAGEN v4或v3服务器或Illumina Connected Analytics平台上运行的脱机版软件来生成样本输出,包括高级样本指标、检测到的变异以及TMB和MSI评分。使用Illumina Connected Insights或Velsera CGW进行三级分析。

BaseSpace Sequence Hub评估应用程序也仅供评估使用。因美纳没有义务为该应用程序提供技术支持。访问期限为30天。

了解更多有关兼容分析软件产品的信息。

在DRAGEN服务器上分析24个文库的S4运行大约需要20-24小时,分析8个文库的S2运行大约需要9-12小时。

是的,您可以使用自己的软件进行分析。不过,在此情况下,因美纳将无法直接提供技术支持。

建议使用约20 ng起始cfDNA,以便在灵敏度大于90%,特异性大于95%的情况下实现VAF约为0.2%的SNV检测;不过,该检测可接受的cfDNA起始量范围为10-30 ng。

案例研究

因美纳与日本国立癌症研究中心合作解决亚洲的主要死因

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支持数据和图像

 

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