适用于MiniSeq系统的试剂和文库制备试剂盒包

一起订购MiniSeq试剂和文库制备试剂盒,能节省更多费用且更为方便。选择产品20005611并添加至购物车。

TruSight RNA Pan-Cancer Panel

靶向1385个癌症基因进行基因表达、变异和融合检测研究,可用于多种RNA样本类型,包括血液、骨髓和福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织。 阅读更多...
选择产品

TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set A

RS-303-1002

TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set B

RS-303-1003

TruSight RNA Pan-Cancer Set A MiniSeq Kit

20005611

Trusight RNA Pan-Cancer Oligo Panel

20046104

产品特色

TruSight RNA Pan-Cancer panel可进行癌症转录组的全面分析。它能提供:

  • 基因表达信息、变异检出以及已知和新型基因融合伴侣的融合检测
  • 优化的低起始量方案,适用于一系列样本类型,包括FFPE样本
  • 癌症通路的全面视图
  • 台式测序仪上的经济型RNA测序(RNA-Seq)
高灵敏度且经济实惠的靶向测序

TruSight RNA Pan-Cancer panel能进行基因表达的定量检测,也能进行已知和新型基因融合伴侣的基因融合检测。该panel能够检测总RNA起始量低至10 ng的样本(或起始量低至20 ng的FFPE样本)。这款panel主要关注一部分相关基因,能在台式测序仪上实现高灵敏度的RNA-Seq,能让任何实验室经济高效地实现NGS。

直观的云端数据分析

BaseSpace RNA-Seq Alignment App可用于数据分析。这款直观的工具能进行融合检出和变异检测,可提供基因表达图谱,为癌症研究提供了综合的解决方案。

TruSight RNA Pan-Cancer样本数据集

注意,登录后才能访问该数据。
注册BaseSpace Sequence Hub账号

MiSeq数据

使用TruSight RNA Pan-Cancer Panel制备了10 ng的人类参考RNA(UHR)、人脑参考RNA(脑)、细胞系RNA(MCF7)和20 ng的乳腺癌(BT)FFPE RNA,在MiSeq系统上进行测序。Read定位和融合检出是在BaseSpace Sequence Hub上使用RNA-Seq Alignment应用程序和STAR比对器进行的。

查看项目

MiniSeq数据

使用TruSight RNA Pan-Cancer panel制备人类参考RNA(HBRR和UHRR)、细胞系RNA(MCF7)和乳腺癌RNA样本,在MiniSeq系统上以2x76 bp的读长使用单标签对8个样本进行了测序。总产量为4.2 Gb,其中96.8%的碱基分值大于等于Q30。

浏览BaseSpace Sequence Hub中的数据:

经常一并购买

规格

计划推荐

仪器 推荐的样本数 读长
MiniSeq System 每次运行的样本:中通量:2–3,高通量:8(基于每个样本300万条read) 2×75 bp(最大推荐值)
MiSeq System 每次运行8个样本(v3试剂,基于每个样本300万条read) 2×75 bp(最大推荐值)

产品比较

TruSight RNA Pan-Cancer TruSight RNA Fusion Panel
内容说明 具有1385个靶标基因和21,043个靶向外显子区域的泛癌panel。包括507个涉及癌症基因融合的基因。 靶向507个癌症相关融合基因和7690个外显子的基因融合panel
分析时间 2.5天 2.5天
手动操作时间 11小时 11小时
物种类别 人类 人类
特殊的样本类型 低起始量样本, FFPE组织 低起始量样本, FFPE组织
癌症类型 泛癌种 实体瘤, 泛癌种
说明 对癌症相关RNA转录本开展全面评估,从而研究多种癌症类型的基因融合、变异和基因表达变化。 只需简单的分析解决方案,即可对507个融合相关基因中的已知和未知伴侣进行基因融合检测研究。
起始量 10 ng总RNA, 20 - 100 ng FFPE RNA 10 ng总RNA, 20–100 ng FFPE RNA

具体的方法工作流程范例

 

相关产品