MethylationEPIC v1.0将于2023年年中停产,Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit是推荐的替代产品。因美纳始终致力于为您提供高质量的支持和服务。

Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit

Robust methylation profiling microarray with extensive coverage of CpG islands, genes, and enhancers. Use for epigenome-wide association studies. 阅读更多...
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Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip Kit (8样本)

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Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip Kit (16样本)

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Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip Kit (32样本)

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EPIC v2.0 Semi-Custom Kits

Inf MethylationEPIC-8+ v2.0 Kit (16 Spl)

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Inf MethylationEPIC-8+ v2.0 Kit (32 Spl)

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Inf MethylationEPIC-8+ v2.0 Kit (96 Spl)

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Services

Infinium® Assay: An Introduction – Customer Site

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产品特色

Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip Kit是一种全基因组甲基化筛选工具,靶向人类甲基化组最具生物学意义的区域中超过935,000个CpG位点,同时在其前代产品MethylationEPIC v1.0的基础上极大的提高了向后兼容性。该芯片保留了以单核苷酸分辨率定量分析全基因组CpG的能力,同时提供高度准确和精确的甲基化测量,不受测序深度的影响。可使用精简、用户友好的Infinium甲基化检测分析多种DNA样本类型,包括从FFPE分离的DNA样本。与其他方法相比,MethylationEPIC v2.0具有可扩展性和更低的单个样本总成本,因此可用于筛选大型队列,发现关于疾病机制的有影响力的生物学见解。

全基因组,前沿内容

根据专家对EPIC v1.0的评估,去除了性能不佳的探针,替换为前沿内容,以便为表观遗传学研究提供更强大的发现能力。EPIC v2.0上新增的186,000个CpG靶向增强子和超级增强子、更多CTCF结合位点、CNV检测区域、EPIC v1.0覆盖不足的CpG岛以及常见癌症驱动突变。更新后的v2.0 Beadchip也可分析通过ATAC-Seq和ChIP-seq实验鉴定的染色质开放区域。有关MethylationEPIC v2.0所覆盖内容的详细说明请参阅产品数据表

值得信赖的技术

Illumina Methylation BeadChip支持表观遗传学领域的突破性研究已有十余年,迄今为止大多数已发表的全表观基因组关联研究(EWAS)都是利用MethylationEPIC或其前代产品HumanMethylation450完成的。因此,研究人员可受益于诸如Gene Expression Omnibus(GEO)或癌症基因组图谱计划(TCGA)数据库中公开的大量甲基化芯片数据。此外,根据甲基化芯片数据建立了肿瘤和其他疾病的机器学习分类方法,可通过甲基化BeadChip数据格式轻松访问。

简单的数据分析

MethylationEPIC v2.0数据分析由GenomeStudio Methylation Module提供支持。GenomeStudio软件可实现直观的初级分析和质量控制。它具有直观的可视化工具,让研究人员能够在单幅图(如热图、散点图和曲线图)中查看数据。对于高级下游分析,R软件框架中的许多免费软件包支持甲基化数据的归一化和差异分析(SeSAMe、minfi等)。视频教程和全面用户指南介绍了这些数据分析包的用法。

兼容多种样本类型,包括FFPE

Infinium甲基化检测的可靠性有助于从FFPE组织样本获得高质量数据。FFPE兼容性对于癌症研究极为重要,能够支持以大型肿瘤生物样本库为基础的研究。Infinium检测同样兼容新鲜/冷冻组织、全血、口腔细胞、cfDNA、唾液和其他样本类型。

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规格

具体的方法工作流程范例

 

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