AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2

研究小组有针对性地调查了50个已知的与癌症相关的基因。 阅读更多...
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Panel

AmpliSeq™ Cancer HotSpot Panel v2 for Illumina®

20019161


Library Prep

AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®

20019101

AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®

20019102

AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®

20019103


Index Adapters

AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24 Indexes, 24 Samples)

20019104

AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®

20019105

AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®

20019106

AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®

20019107

AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®

20019167

AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples)

20031676

配件产品

AmpliSeq™ for Illumina® Sample ID Panel

20019162

AmpliSeq™ for Illumina® Direct FFPE DNA

20023378

AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®

20019171

产品特色

AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2是一款靶向重测序分析套装,用于研究50个基因的热点区域体细胞突变,癌症体细胞突变目录(COSMIC)1数据库已确认这些基因与癌症有关联。主要特点包括:

相关基因内容
  • 在50个癌基因和抑癌基因中靶向约2800个COSMIC突变
快速的一体化工作流程
  • 可在一天内使用起始量低至1 ng的高质量样本或10 ng福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)的样本并制备用于直接测序的文库
准确的数据
  • 使用本地或云端分析方法检测变异等位基因频率低至5%的体细胞突变

Cancer HotSpot Panel是集成工作流程的一部分,该工作流程包括基于AmpliSeq for Illumina聚合酶链式反应(PCR)的文库制备、采用因美纳边合成边测序(SBS)的新一代测序(NGS)技术以及自动化分析过程。

这种panel能够对肺癌、结肠癌、乳腺癌、卵巢癌、黑色素瘤及前列腺癌等多种癌症类型实现高灵敏的变异检测。即用型panel助您节省鉴定目标基因、设计引物和优化panel所需的时间和精力。

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规格

计划推荐

仪器 推荐的样本数 读长
iSeq 100 System 每次运行16个样本(假设最小覆盖度为500倍) 2 × 150 bp
MiniSeq System 每次运行的样本:中通量:32,高通量:96(假设最小覆盖度为500倍) 2 × 150 bp
MiSeq System 每次运行的样本(按试剂盒版本):v2 nano:4,v2 micro:16,v2:60,v3:96(假设最小覆盖度为500倍) 2 × 150 bp

产品比较

AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 AmpliSeq for Illumina Focus Panel AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 TruSight Tumor 15
内容说明 50种与癌症具有已知关联的基因的热点区域 52个癌基因的DNA和RNA靶点 161个癌基因的DNA和RNA靶点 从15个实体瘤相关基因中扩增250个扩增子
分析时间 5小时(仅包括文库制备时间;不包括文库定量、归一化或混合时间) 5-6小时(仅为文库制备时间,不包括文库定量、归一化或混合时间) 5-6小时(仅为文库制备时间,不包括文库定量、归一化或混合时间) 7小时
多重分析 96个双标签序列组合 96个双标签序列组合 96个双标签序列组合 1-24重
方法 扩增子测序, 靶向DNA测序 扩增子测序, 靶向RNA测序, 靶向DNA测序 扩增子测序, 靶向RNA测序, 靶向DNA测序 扩增子测序, 靶向DNA测序
核酸类型 DNA DNA, RNA DNA, RNA DNA
物种类别 人类 人类 人类 人类
特殊的样本类型 FFPE组织 FFPE组织 FFPE组织 FFPE组织
癌症类型 泛癌种, 实体瘤 实体瘤 实体瘤 实体瘤
说明 针对50个癌症相关基因的热点区域的体细胞分析研究。 针对52个实体瘤相关基因的体细胞分析研究。 针对实体瘤相关基因热点及全长靶点的体细胞分析研究。 重点panel,使用简单的工作流程研究15个基因中的相关实体瘤体细胞变异。
起始量 1–100 ng(建议每个混池10 ng) 1–100 ng(建议每个混池10 ng) 1–100 ng(建议每个混池10 ng) 20 ng

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References
  1. Kingsmore S. Catalogue of Somatic Mutations in Cancer – Home Page. http://cancer.sanger.ac.uk/cosmic. Accessed October 25, 2017.