Myeloid Panel可在一次实验分析中同时分析血液和骨髓样本的DNA和RNA,研究与血液恶性肿瘤相关的生物标记。该panel覆盖急性骨髓性白血病(AML)、骨髓增生异常综合征(MDS)、骨髓增殖性肿瘤(MPN)、慢性骨髓性白血病(CML)、慢性骨髓单核细胞性白血病(CMML)和青少年骨髓单核细胞性白血病(JMML)等主要骨髓疾病的相关靶点。主要特点包括:
Myeloid Panel是集成工作流程的一部分,该工作流程包括基于AmpliSeq for Illumina聚合酶链式反应(PCR)的文库制备、采用Illumina边合成边测序(SBS)的新一代测序(NGS)技术以及自动化分析过程。
即用型panel助您节省鉴定目标基因、设计引物和优化panel所需的时间和精力。
仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
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MiniSeq System | 每次运行的样本(中通量):4个DNA样本,32个RNA样本,3个组合样本(基于95%以上的覆盖度>500倍) 每次运行的样本(高通量):12个DNA样本,96个RNA样本,11个组合样本(基于95%以上的覆盖度>500倍) |
2 x 151 bp 2 x 151 bp |
MiSeq System | 每次运行的样本(v2试剂):7个DNA样本,60个RNA样本,6个组合样本 每次运行的样本(v3试剂):12个DNA样本,96个RNA样本,11个组合样本 |
2 x 151 bp 2 x 151 bp |
AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel | AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 | TruSight Myeloid Sequencing Panel | |
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内容说明 | Targets biomarkers across 69 genes (40 key DNA target genes, 29 RNA fusion driver genes, and 5 gene expression levels) | 50种与癌症具有已知关联的基因的热点区域 | Targets 54 genes associated with myeloid malignancies. Probes amplify 568 amplicons from tumor suppressor genes and mutational hotspots. |
分析时间 | 5.5–7.5小时(仅包括文库制备时间,不包括文库定量、归一化或混合时间) | 5小时(仅包括文库制备时间;不包括文库定量、归一化或混合时间) | 8小时 |
变异种类 | 体细胞变异, 基因融合, 插入缺失 (indels), 单核苷酸多态性 (SNPs) | 体细胞变异, 插入缺失 (indels), 单核苷酸多态性 (SNPs) | 体细胞变异, 插入缺失 (indels) |
多重分析 | 多达96重 | 96个双标签序列组合 | 多达96重 |
手动操作时间 | <1.5小时 | <1.5小时 | 3小时 |
方法 | 扩增子测序, 靶向RNA测序, 靶向DNA测序 | 扩增子测序, 靶向DNA测序 | 扩增子测序, 靶向DNA测序 |
核酸类型 | RNA, DNA | DNA | DNA |
物种类别 | 人类 | 人类 | 人类 |
特殊的样本类型 | Bone Marrow, Not FFPE-Compatible, 血液 | FFPE组织 | 不兼容FFPE, Not FFPE-Compatible |
癌症类型 | 血液恶性肿瘤 | 泛癌种, 实体瘤 | 血液恶性肿瘤 |
说明 | Targeted panel to study 40 DNA genes, 29 RNA fusion driver genes, and 5 gene expression levels associated with myeloid cancers. | 针对50个癌症相关基因的热点区域的体细胞分析研究。 | For somatic mutation detection studies in myeloid malignancies. |
起始量 | 20 ng高质量DNA;10 ng高质量RNA (建议每个池10 ng) |
1–100 ng(建议每个混池10 ng) | 50 ng |
Automated Solutions for AmpliSeq for Illumina Sequencing Panels
Application Note | HTML
AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel Data Sheet
Data Sheet | HTML
AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel Reference Guide Documentation
Illumina Adapter Sequences Documentation
AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel Support - Documentation & Literature
AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel Checklist Documentation
Index Adapters Pooling Guide Documentation
自定义协议选择器
Generates customized, end-to-end instructions