产品

Illumina DNA PCR-Free Prep

高效、快速且集成的文库制备工作流程，可为对灵敏度要求高的测序应用生成高度准确的数据。

约1.5小时

分析时间

约45分钟

手动操作时间

25-300 ng

起始量

详情请参见规格表

概述

Illumina DNA PCR-Free Prep为制备文库提供了快速灵活的工作流程，可用于灵敏的全基因组测序应用，例如人类全基因组测序（WGS）、微生物基因组的从头组装和肿瘤-正常变异检出。

  • 通过消除文库定量前和文库定量后步骤降低成本

  • 在重复或不均匀的基因组区域提供高度均一的覆盖度

  • 在90分钟内提供快速、自动化兼容的工作流程

简化实验室操作

Illumina DNA PCR-Free Prep工作流程支持广泛的DNA起始量范围、多种样本类型以及小型和大型基因组。这个流程包括从血液、唾液、干血斑中提取DNA。

获得可靠的结果

磁珠上酶切法片段化化学技术与无PCR文库制备相结合，消除了PCR诱导的偏差，减少了出错的机会，在高GC或-AT区域提供出色、均匀的覆盖。深入了解磁珠上酶切法片段化。

获得灵活的通量

Illumina DNA/RNA UD Indexes Set提供多达384个唯一双标签序列，可准确分配read并高效使用流动槽。

深入了解多重分析

Illumina DNA Prep产品系列

查找快速、优化的测序文库制备解决方案，适用于各种应用。

Illumina DNA PCR-Free Prep

高效、快速且集成的文库制备工作流程，可为对灵敏度要求高的测序应用生成高度准确的数据。

Illumina DNA Prep

快速、集成的工作流程，用于制备文库，用于广泛的测序应用。

Illumina DNA Prep with Enrichment

快速、集成的工作流程，为广泛的靶向测序应用提供可直接用于测序的DNA文库。

深入了解Illumina DNA Prep产品系列

性能参数

Automation capability Liquid Handling Robots
Method Whole-Genome Sequencing, De Novo Sequencing
Specialized sample types Not FFPE-Compatible, Low-Input Samples, Blood, Saliva
Variant class Short tandem repeats (STRs), Chromosomal abnormalities, Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants, Somatic variants
作用机制 链接磁珠转座酶
分析时间 约1.5小时
多重分析 高达384重
手动操作时间 约45分钟
技术 Illumina测序
核酸类型 DNA
物种 人, 任意
目标插入片段大小 450 bp +/- 75 bp
系统 MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System
自动化详情 探索可用的自动化方法
说明

使用磁珠上酶切法片段化与无PCR化学反应的独特组合，为灵敏的应用制备测序文库，同时消除了PCR诱导的偏差，并将文库制备总时间缩短至90分钟。
起始量 25-300 ng
Variant class Short tandem repeats (STRs), Chromosomal abnormalities

所需产品

购买除NovaSeq 6000系统外所有仪器的Illumina DNA PCR-Free测序和标签引物（货号20041797）。

标签接头是可选的，但建议用于多重分析。选择符合您样本通量所需的标签数量。 我们建议订购Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A-D (20091654、20091656、20091658、、20091660）。IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A-D （(20027213、20027214、20042666、20042667）正在停产。

深入了解多重分析。

Illumina Lysis Kit仅用于处理血液样本。

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应用

Illumina DNA PCR-Free Prep可在约1.5小时内为肿瘤-正常变异鉴定或人类全基因组测序（WGS）等敏感应用提供无需PCR的测序文库。

工作流程示例

1
制备

Illumina DNA PCR-Free Prep

2
测序
3
分析

特色应用说明

采用Illumina DNA PCR-Free Prep, Tagmentation进行微生物全基因组测序
采用Illumina DNA PCR-Free Prep, Tagmentation进行高效的全基因组测序
采用Illumina DNA PCR-Free Prep, Tagmentation调节插入片段大小

项目建议

仪器 Recommended number of samples Read length
NovaSeq 6000 System

S1: 3 (based on 607M reads, 40× coverage, or > 160 Gb of total data passing filter)

S2: 6 (based on 663M reads, 40× coverage, or > 160 Gb of total data passing filter)

S4: 16 (based on 669M reads, 40× coverage, or > 160 Gb of total data passing filter)

2 × 150 bp

相关应用和方法

人类全基因组测序

人类全基因组测序可以帮助我们以最详细的方式了解人类独有的复杂遗传变异。

文库制备自动化

通过我们的自动化合作伙伴提供高通量和低通量无人值守自动化方法，减少手动操作时间，减少错误。

肿瘤-正常测序

肿瘤-正常研究包括比较肿瘤和匹配的正常样本，以发现作为癌症驱动突变的体细胞变异。 

文档

产品资料
Support documentation

比较

Illumina DNA PCR-Free Prep Illumina DNA Prep TruSeq DNA PCR-Free TruSeq DNA Nano
Automation capability Liquid Handling Robots Liquid Handling Robots Liquid Handling Robots Liquid Handling Robots
Method Whole-Genome Sequencing, De Novo Sequencing Shotgun Sequencing, Whole-Genome Sequencing, De Novo Sequencing, Amplicon Sequencing Shotgun Sequencing, Whole-Genome Sequencing, Genotyping by Sequencing Shotgun Sequencing, Whole-Genome Sequencing, Genotyping by Sequencing
Specialized sample types Not FFPE-Compatible, Low-Input Samples, Blood, Saliva Not FFPE-Compatible, Blood, Saliva Not FFPE-Compatible Not FFPE-Compatible, Low-Input Samples
Variant class Short tandem repeats (STRs), Chromosomal abnormalities, Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants, Somatic variants Gene fusions, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants, Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants Gene fusions, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants, Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants Gene fusions, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants, Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants
作用机制 链接磁珠转座酶 链接磁珠转座酶 机械DNA片段化和接头连接。工作流程无PCR且无凝胶。 机械DNA片段化和接头连接。工作流程采用降低偏向性的PCR，无凝胶。
分析时间 约1.5小时 约3-4小时（从DNA提取到归一化文库） 总检测时间5小时

总检测时间约为6小时
多重分析 高达384重 多达384个唯一双（UD）标签组合和96个组合（CD）双标签组合 多达24个单标签、96个组合（CD）双标签、24个唯一双标签以及96个唯一双（UD）标签组合 多达24个单标签、96个组合（CD）双标签、24个唯一双标签以及96个唯一双（UD）标签组合
手动操作时间 约45分钟 1-1.5小时 4小时 约4小时
技术 Illumina测序 Illumina测序 Illumina测序 Illumina测序
核酸类型 DNA DNA DNA DNA
物种 人, 任意 Drosophila, Mammalian, 小鼠, Yeast, Zebrafish, 人, 大鼠, Plant, Virus, Nematode, Bacteria, 任意 Other, Mammalian, 小鼠, 人, 大鼠, Plant Other, Mammalian, 小鼠, 人, 大鼠, Plant
目标插入片段大小 450 bp +/- 75 bp ~350 bp 350 bp或550 bp 350 bp或550 bp
系统 MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System
自动化详情 探索可用的自动化方法 探索可用的自动化方法 探索可用的自动化方法 探索可用的自动化方法
说明

使用磁珠上酶切法片段化与无PCR化学反应的独特组合，为灵敏的应用制备测序文库，同时消除了PCR诱导的偏差，并将文库制备总时间缩短至90分钟。

快速、灵活的文库制备工作流程，可适应各种样本类型和DNA起始量，可用于从人类到微生物全基因组测序等各种应用。 

 用于全基因组测序研究的简单、一站式无PCR制备方法，可对具有挑战性的基因组区域进行测序。 低起始量研究方法，可提供较高的基因组覆盖度质量，减少偏差。
起始量 25-300 ng 1-500 ng DNA用于小型基因组（例如微生物），或100-500 ng DNA用于大型基因组（例如人类）。（对于血液和唾液样本，请参阅参考指南）。 1 ug DNA 100 ng基因组DNA

选择工具：

文库制备和芯片试剂盒选择器

寻找符合您需求的测序文库制备试剂盒或芯片。按方法、种类等筛选。比较、分享和订购试剂盒。

图

Illumina DNA PCR-Free Prep化学技术

在单次快速反应中将磁珠上酶切法片段化与无PCR工作流程的独特结合。

高GC区域read覆盖度对比

与TruSeq DNA PCR-Free和TruSeq DNA Nano Library Prep Kit相比，Illumina DNA PCR-Free Prep Kit在人RNPEPL1基因富含GC的启动子区域具有出色的read覆盖度。

Illumina DNA PCR-Free Prep覆盖均一性

Illumina DNA PCR-Free Prep能均匀覆盖人类基因组中的各种GC含量。

Illumina DNA PCR-Free Prep在各种DNA起始量中的性能

使用一系列DNA起始量制备的Illumina DNA PCR-Free Prep文库证明（A）所有DNA起始量均符合质量规格，（B）具有同等的检出性能。

相关资源

缩略图

Illumina DNA PCR-Free Prep， Tagmentation：简介

本次网络研讨会讨论了文库制备工作流程和测序注意事项，并提供了成功开展新一代测序项目的技巧。

文库制备 (2)

Illumina® DNA PCR-Free Prep, Tagmentation (24 Samples)

20041794

包含用于制备24个文库的试剂和Illumina纯化磁珠。单独购买标签接头。

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Illumina® DNA PCR-Free Prep, Tagmentation (96 Samples)

20041795

包含用于制备96个文库的试剂和Illumina纯化磁珠。单独购买标签接头。

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标签接头 (8)

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091654

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091656

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091658

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091660

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027213

包含96、10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20042666

包含96、10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20042667

包含96、10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027214

包含96、10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。

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服务 (1)

Illumina DNA PCR-Free Prep Training

20046010

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配套产品 (2)

Illumina® DNA PCR-Free Sequencing and Indexing Primer

20041797

包括两管7.5 mL VP10定制read 1引物和两管7.5 mL VP14定制标签2引物，用于iSeq 100、MiniSeq、NextSeq 500/550、NextSeq 1000/2000和HiSeq 3000/4000系统。

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Illumina® Lysis Kit

20042221

包含一个使用Illumina DNA PCR-Free Prep处理血液样本的裂解试剂盒。单独购买文库制备和标签接头。

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常见问题解答

无需PCR的文库制备是在不使用PCR扩增的情况下构建DNA文库。Illumina DNA PCR-Free化学技术消除了PCR诱导的偏差，为灵敏的应用提供了高度准确的序列信息。

无需PCR的文库制备使用磁珠连接的转座酶复合物，通过在单个快速反应步骤中片段化并添加接头标签序列来标记基因组DNA。单反应步骤称为磁珠上酶切法片段化。磁珠连接的转座酶用DNA饱和后，不会发生额外的酶切法片段化，从而产生一致的文库产量和插入片段大小。 深入了解磁珠上酶切法片段化

 

PCR-free测序无需PCR扩增步骤，显著减少了典型的PCR诱导的偏向性和不均匀的扩增。

Illumina DNA PCR-Free Prep工作流程采用磁珠上酶切法片段化，无论DNA起始量或基因组大小如何，都能在单次快速反应中实现一致的插入片段大小、均一的覆盖度和增强的性能。磁珠上酶切法片段化无需PCR扩增步骤，最大限度地减少了碱基组成偏差和出错的机会，使该试剂盒成为灵敏测序应用的理想选择。

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将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。

MiSeq Reagent Kit v3

经过优化的试剂盒，可提供更高的簇密度和读长，与早期版本相比，提高了测序质量分值。

TruSight Oncology 500

靶向多种变异类型（包括微卫星不稳定性（MSI）和肿瘤突变负荷（TMB））的检测。

Illumina DNA Prep

快速、集成的工作流程，用于制备文库，用于广泛的测序应用。

TruSight Oncology 500 ctDNA v2

使用能够检测血浆中ctDNA的关键IO基因特征（TMB、MSI）以及所有主要变异类别的泛癌panel进行CGP分析。

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