Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit

简化的工作流程可对包括SARS-CoV-2毒株在内的常见呼吸道病毒进行高度灵敏的检测和表征。

Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit

简化的工作流程可对包括SARS-CoV-2毒株在内的常见呼吸道病毒进行高度灵敏的检测和表征。

文库制备时间＜9小时

分析时间

文库制备时间＜2小时

手动操作时间

10-100 ng

起始量

详情请参见规格表

Respiratory Virus Oligo Panel v2（RVOP v2，货号20044311）现在以综合试剂盒（Set A-D）出售，其中包括Respiratory Virus Oligo Panel V2、文库制备和富集试剂以及标签接头。独立RVOP v2产品或单个组件可通过MyIllumina购买。

概述

Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit， 原名为Respiratory Virus Oligo Panel（RVOP），为检测SARS-CoV-2和甲型/乙型流感等常见呼吸道病毒提供了一种有效、简化的方法。 

  • 了解用于病毒进化或病毒监测的变异分析1

  • 确定病毒传播模式并预测复发

  • 鉴定并鉴定合并感染及其在复杂疾病中的作用

用于呼吸道病毒检测的靶向富集

通过杂交捕获方法进行靶向富集可实现高度灵敏的检测，而不需要鸟枪法宏基因组测序所需的高read深度。此外，与扩增子测序相比，该方法允许使用更大的探针panel进行全面分析，同时生成靶向病毒的全基因组测序数据。

适用于病毒应用的简化解决方案

这种全面的工作流程整合了文库制备、靶向富集、测序和数据分析，让研究人员和公共卫生科学家能够通过一个工作流程监测多种病毒和变异

性能参数

Automation capability Liquid Handling Robots
Method Target Enrichment, Targeted RNA Sequencing, Targeted DNA Sequencing
Variant class Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Single nucleotide polymorphisms (SNPs)
作用机制 磁珠上酶切法片段化，然后进行单个杂交步骤
内容说明 靶向并表征约40种常见呼吸道病毒，包括SARS-CoV-2、甲型和乙型流感病毒、腺病毒、鼻病毒、呼吸道合胞病毒和其他常见呼吸道病毒。
分析时间 文库制备时间＜9小时
多重分析 使用唯一双标签，单次运行最多可分析384个样本
手动操作时间 文库制备时间＜2小时
技术 Illumina测序
样本类型详情

鼻拭子和清洗液、废水等
核酸类型 DNA, RNA
物种 人, Virus
物种详情 检测常见呼吸道病毒，包括最近的流感毒株和SARS-CoV-2。该panel包括作为阳性对照的人类靶标探针，因此可以在每个分析样本中检测到这些人类靶标。
系统 MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, MiniSeq System
自动化详情 探索可用的自动化方法
说明 用于检测和分析SARS-CoV-2和其他常见呼吸道病毒的简化工作流程。不可知的设计允许广泛鉴定多种目标样本类型的致病病毒。
起始量 10-100 ng

所需产品

Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit包含Respiratory Virus Oligo Panel（RVOP）v2、Illumina RNA Prep with Enrichment以及四种可用的唯一双标签板之一。要一次运行384个样本，请订购所有4组样本（A、B、C和D）。所需的其他因美纳试剂包括因美纳测序仪以及相应的测序试剂和流动槽。
/

应用

Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit、Illumina测序和DRAGEN二级分析提供了简化的工作流程，能够检测和鉴定40多种常见的人类呼吸道病毒。 

工作流程示例

1
制备

Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit

2
测序
3
分析

项目建议

仪器 Recommended number of samples Read length
MiniSeq System Rapid: 20 samples, 1M clusters and a minimum of 1M single-end reads per sample 1 × 100 bp
MiSeq System v3 reagents: ~20 samples, 1M clusters and a minimum of 1 M single-end reads per sample 1 × 150 bp
NextSeq 550 System High output: 384 samples, 1M clusters and a minimum of 1M single-end reads per sample 1 × 150 bp

相关应用和方法

靶向富集

目标富集可通过杂交捕获感兴趣的基因组区域。了解有关目标富集的更多信息，及其用于一次评估多个样本的方法。

冠状病毒测序

NGS can identify novel coronavirus variants, track COVID-19 transmission, and more. Compare NGS methods for various coronavirus sequencing goals.

传染性疾病研究

NGS作为一种无假设的方法，可以区分仅相差一个SNP的传染性疾病菌株，并替代多重检测。

文档

产品资料
支持文档

比较

Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit
Automation capability Liquid Handling Robots Liquid Handling Robots
Method Target Enrichment, Targeted RNA Sequencing, Targeted DNA Sequencing Target Enrichment, Targeted RNA Sequencing, Targeted DNA Sequencing
Variant class Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Single nucleotide polymorphisms (SNPs)
作用机制 磁珠上酶切法片段化，然后进行单个杂交步骤 磁珠上酶切法片段化，然后进行单个杂交步骤
内容说明 靶向并表征约40种常见呼吸道病毒，包括SARS-CoV-2、甲型和乙型流感病毒、腺病毒、鼻病毒、呼吸道合胞病毒和其他常见呼吸道病毒。 同时检测呼吸道病原体DNA和RNA，同时分析抗菌药物耐药性（AMR）基因表达。
分析时间 文库制备时间＜9小时 文库制备时间＜9小时
多重分析 使用唯一双标签，单次运行最多可分析384个样本 使用唯一双标签，单次运行最多可分析384个样本
手动操作时间 文库制备时间＜2小时 文库制备时间＜2小时
技术 Illumina测序 Illumina测序
样本类型详情

鼻拭子和清洗液、废水等
核酸类型 DNA, RNA DNA, RNA
物种 人, Virus Fungal, Virus, Bacteria
物种详情 检测常见呼吸道病毒，包括最近的流感毒株和SARS-CoV-2。该panel包括作为阳性对照的人类靶标探针，因此可以在每个分析样本中检测到这些人类靶标。 检测呼吸道病原体（180多种细菌、50多种真菌和40多种病毒，包括SARS-CoV-2）和抗菌药物耐药性等位基因（1200多种）。
系统 MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, MiniSeq System MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, MiniSeq System
自动化详情 探索可用的自动化方法 探索可用的自动化方法
说明 用于检测和分析SARS-CoV-2和其他常见呼吸道病毒的简化工作流程。不可知的设计允许广泛鉴定多种目标样本类型的致病病毒。 鉴定呼吸道感染和合并感染，检测抗菌药物耐药性标志物，并对关键病原体（SARS-CoV-2和Flu A/B病毒）进行菌株分型，以研究病毒的进化和传播。
起始量 10-100 ng 基于体积（非浓度依赖性）

选择工具

文库制备和芯片试剂盒选择器

寻找符合您需求的测序文库制备试剂盒或芯片。按方法、种类等筛选。比较、分享和订购试剂盒。

基因panel和芯片查找工具

针对您感兴趣的基因，帮助您找到适合的测序panel和芯片。

图

用于呼吸道病毒检测的富集工作流程

用于呼吸道病毒检测的一体化NGS工作流程整合了样本制备、文库制备、靶向富集、测序和数据分析。

高灵敏度SARS-CoV-2检测

在对掺有一定量的病毒拷贝的人类唾液RNA进行滴定实验时，Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit能够从低至两个拷贝的SARS-CoV-2病毒RNA中检测到病毒read。

Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit检测的病毒

Respiratory Virus Oligo Panel包含7800个探针，可检测常见的呼吸道病毒、最近的流感毒株、SARS-CoV-2和人类探针，作为阳性对照。所有探针均为80-mer寡核苷酸，彼此间隔非常近，可对panel中的所有病毒进行全基因组覆盖。

人冠状病毒229E 人副流感病毒1型 人博卡病毒4型NI病毒株HBoV4-NI-385 甲型流感病毒（A/Zhejiang/DTID-ZJU01/2013(H7N9)）
人冠状病毒NL63 人类副流感病毒2型 KI多瘤病毒Stockholm 60 甲型流感病毒（A/Hong Kong/1073/99(H9N2)）
人冠状病毒OC43 人副流感病毒3型 WU多瘤病毒 甲型流感病毒（A/Texas/50/2012(H3N2)）
人冠状病毒HKU1 人副流感病毒4a型 人双埃柯病毒1型PicoBank/HPeV1/a 甲型流感病毒（A/Michigan/45/2015(H1N1)）
SARS-CoV-2 人类偏肺病毒（CAN97-83） 人双埃柯病毒6型 乙型流感病毒（B/Lee/1940）
人腺病毒B1型 呼吸道合胞病毒（A型） 人鼻病毒A89 乙型流感病毒（B/Wisconsin/01/2010）
人腺病毒C2型 人类呼吸道合胞病毒9320（B型） 人鼻病毒C型（病毒株024） 乙型流感病毒（B/Brisbane/60/2008）
人腺病毒E4型 甲型流感病毒（A/Puerto Rico/8/1934(H1N1)） 人鼻病毒B14 乙型流感病毒（B/Colorado/06/2017）
人博卡病毒1型（灵长类博卡病毒1型分离株st2） 甲型流感病毒（A/Korea/426/1968(H2N2)） 人类肠病毒C104病毒株：AK11 乙型流感病毒（B/Washington/02/2019）
人博卡病毒2c型PK分离株PK-5510 甲型流感病毒（A/New York/392/2004(H3N2)） 人类肠病毒C109分离株NICA08-4327 人类对照基因
人博卡病毒3型 甲型流感病毒（A/goose/Guangdong/1/1996(H5N1)）    

Illlumina Respiratory Virus Enrichment Kit Set A (96 indexes, 96 samples)

20100469

完整的基于杂交的富集试剂盒，包括Illumina RNA Prep with Enrichment文库制备和杂交试剂、Respiratory Virus Oligo Panel v2和IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A。每个试剂盒在32次杂交反应中提供足够用于96个样本的试剂，每次杂交反应3个文库。可富集40种常见的人类呼吸道病毒，包括SARS-CoV-2和流感病毒，并生成每种靶向病毒的全基因组序列。

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Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit Set B (96 indexes, 96 samples)

20100470

完整的基于杂交的富集试剂盒，包括Illumina RNA Prep with Enrichment文库制备和杂交试剂、Respiratory Virus Oligo Panel v2和IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B。每个试剂盒在32次杂交反应中提供足够用于96个样本的试剂，每次杂交反应3个文库。可富集40种常见的人类呼吸道病毒，包括SARS-CoV-2和流感病毒，并生成每种靶向病毒的全基因组序列。

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Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit Set C (96 indexes, 96 samples)

20100471

完整的基于杂交的富集试剂盒，包括Illumina RNA Prep with Enrichment文库制备和杂交试剂、Respiratory Virus Oligo Panel v2和IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C。每个试剂盒在32次杂交反应中提供足够用于96个样本的试剂，每次杂交反应3个文库。可富集40种常见的人类呼吸道病毒，包括SARS-CoV-2和流感病毒，并生成每种靶向病毒的全基因组序列。

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Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit Set D (96 indexes, 96 samples)

20100472

完整的基于杂交的富集试剂盒，包括Illumina RNA Prep with Enrichment文库制备和杂交试剂、Respiratory Virus Oligo Panel v2和IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D。每个试剂盒在32次杂交反应中提供足够用于96个样本的试剂，每次杂交反应3个文库。可富集40种常见的人类呼吸道病毒，包括SARS-CoV-2和流感病毒，并生成每种靶向病毒的全基因组序列。

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常见问题解答

Respiratory Virus Enrichment Kit支持多种样本来源，包括福尔马林固定、鼻拭子、鼻洗液和废水样本。

Respiratory Virus Enrichment Kit文库制备和富集方案需要＜9小时，手动操作时间＜2小时。

与MiniSeq Rapid Reagent Kit、MiniSeq Sequencing System和DRAGEN RNA Pathogen Detection App配合使用时，整个过程可在＜24小时内完成。深入了解呼吸道病毒的快速检测。

是的，由于该试剂盒使用基于杂交的富集，并且包含40多种不同病毒的探针，因此可以检测多种病毒。深入了解使用Illumina RNA Prep with Enrichment检测和表征呼吸道病毒。

Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit包括免费使用 DRAGEN RNA Pathogen Detection应用程序 和DRAGEN Targeted Microbial应用程序，两者均可分析病原体数据并生成共有序列。

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订购NovaSeq X系列

将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。

MiSeq Reagent Kit v3

经过优化的试剂盒，可提供更高的簇密度和读长，与早期版本相比，提高了测序质量分值。

TruSight Oncology 500

靶向多种变异类型（包括微卫星不稳定性（MSI）和肿瘤突变负荷（TMB））的检测。

Illumina DNA Prep

快速、集成的工作流程，用于制备文库，用于广泛的测序应用。

Viral Surveillance Panel

通过靶向富集对66种病毒进行全基因组测序和表征，包括SARS-CoV-2、流感和脊髓灰质炎。

MiniSeq Reagent Kit

MiniSeq系统试剂盒有一个即用型夹盒，带有双通道SBS化学技术，即使样本量低，也能实现经济高效的测序。

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