TruSeq DNA Nano

用有限的DNA制备全基因组测序文库,并高效分析样本。

总检测时间约为6小时

分析时间

约4小时

手动操作时间

100 ng基因组DNA

起始量

详情请参见规格表

Illumina DNA Prep 和 Illumina DNA PCR-Free Prep 现已上市。与TruSeq DNA Nano相比,这些文库制备解决方案不仅提高了性能,而且缩短了周转时间和手动操作时间。

概述

TruSeq DNA Nano能够高效检测可用DNA有限的样本。这种低起始量方法 基于机械片段化连接化学技术,可为几乎所有测序应用提供高覆盖度质量和更低的偏向性。

主要特点

  • 专用于低起始量样本

  • 高覆盖质量

  • 快速的文库制备

在一天内手动制备高质量文库

TruSeq DNA Nano用基于磁珠的选择替代了基于凝胶的大小选择,简化了工作流程,使研究人员在一天内即可制备出高质量文库。针对从2 × 101 bp到2 × 151 bp的多种读长进行了优化。

用于有限的DNA样本

TruSeq DNA Nano仅用100 ng的起始量即可获得极佳的结果,没有通常需要微克级DNA的要求。这使研究人员能够研究有限的DNA样本(例如肿瘤样本),且有助于保存样本用于未来的研究或替代研究。除了加速工作流程以外,基于磁珠的大小选择避免了通常与基于凝胶的选择相关的样本损失。

减少文库偏差和覆盖空缺

TruSeq DNA Nano可减少以往PCR导致的覆盖空缺的数量和平均大小。经强化的工作流程能减少文库偏向性并改善基因组中的覆盖度均一性。这些试剂盒还出色地覆盖了以往难以覆盖的基因组内容,包括高GC区域、启动子和重复区域。这使研究人员能够从每次测序运行中获取更多信息。Truseq DNA Nano产品经过验证,可在几乎所有的新一代测序应用中实现高质量的基因组覆盖。

获得灵活的通量选项

  • 带单标签的TruSeq DNA Nano可用于低通量(LT)研究,手动处理24个样本。
  • TruSeq DNA Nano with 96 CD Indexes 支持96个样本的处理,用于高通量(HT)研究,可在液体处理机器人上实现自动化(或手动处理)。
  • IDT for Illumina Unique Dual(UD)Indexes(24或96个标签)的多重性提高,能够准确分配read,高效利用流动槽。

快速、自动化的工作流程

一天内即可制备好用于因美纳测序的文库。Illumina认证方法可通过 我们的合作伙伴在一系列自动化平台上使用。


性能参数


所需产品

Illumina现提供模块化产品的预订,让您的工作流程变得灵活。您可以订购带有以下任何标签的以下任何文库制备产品。 

Illumina Advantage 大规模测序产品提供最高水平的服务和支持,确保运营成功。它们具有特定批次的运输和测试、更长的保质期,以及先进的变更通知,可提高实验室效率。 

Illumina Free Adapter Blocking Reagent是一种可选的酶解解决方案,旨在阻断文库池中的游离接头,以最大限度地降低 标签跳跃的风险。

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应用

工作流程示例


项目建议

仪器 Recommended number of samples Read length
NextSeq 550 System

1 sample per run (based on 30× coverage of a human genome)

350 bp插入片段:≤ 2 × 100 bp
550 bp插入片段:≤ 2 × 150 bp


相关应用和方法

其他人如何使用该产品

比较

TruSeq DNA Nano TruSeq DNA PCR-Free Illumina DNA Prep
Automation capability Liquid Handling Robots Liquid Handling Robots Liquid Handling Robots
Method Shotgun Sequencing, Whole-Genome Sequencing, Genotyping by Sequencing Shotgun Sequencing, Whole-Genome Sequencing, Genotyping by Sequencing Shotgun Sequencing, Whole-Genome Sequencing, De Novo Sequencing, Amplicon Sequencing
Specialized sample types Low-Input Samples, Not FFPE-Compatible Not FFPE-Compatible Not FFPE-Compatible
Variant class Gene fusions, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs), Loss of heterozygosity (LOH), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants, Somatic variants Gene fusions, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs), Loss of heterozygosity (LOH), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants, Somatic variants Gene fusions, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs), Loss of heterozygosity (LOH), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants, Somatic variants
作用机制 机械DNA片段化和接头连接。工作流程采用降低偏向性的PCR,无凝胶。 机械DNA片段化和接头连接。工作流程无PCR且无凝胶。 链接磁珠转座酶
分析时间

总检测时间约为6小时

总检测时间5小时 约3-4小时(从DNA提取到归一化文库)
多重分析 多达24个单标签、96个组合(CD)双标签、24个唯一双标签以及96个唯一双(UD)标签组合 多达24个单标签、96个组合(CD)双标签、24个唯一双标签以及96个唯一双(UD)标签组合 多达384个唯一双(UD)标签组合和96个组合(CD)双标签组合
手动操作时间 约4小时 4小时 1-1.5小时
技术 Illumina测序 Illumina测序 Illumina测序
核酸类型 DNA DNA DNA
物种 Other, Mammalian, 小鼠, 人, 大鼠, Plant Other, Mammalian, 小鼠, 人, 大鼠, Plant Drosophila, Mammalian, 小鼠, Yeast, Zebrafish, 人, 大鼠, Plant, Virus, Nematode, Bacteria
物种详情 与大多数大型DNA基因组兼容。 与大多数大型DNA基因组兼容。 与任何物种兼容
目标插入片段大小 350 bp或550 bp 350 bp或550 bp ~350 bp
系统 MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System
自动化详情 探索可用的自动化方法 探索可用的自动化方法 探索可用的自动化方法
说明 低起始量研究方法,可提供较高的基因组覆盖度质量,减少偏差。 用于全基因组测序研究的简单、一站式无PCR制备方法,可对具有挑战性的基因组区域进行测序。

快速、灵活的文库制备工作流程,可适应各种样本类型和DNA起始量,可用于从人类到微生物全基因组测序等各种应用。 

起始量 100 ng基因组DNA 1 ug DNA 1-500 ng DNA用于小型基因组(例如微生物),或100-500 ng DNA用于大型基因组(例如人类)。(对于血液和唾液样本,请参阅参考指南)。

选择工具:

文库制备 (1)

TruSeq Nano DNA Low Throughput Library Prep Kit (24 samples)

20015964

包含用于制备24个文库的试剂和样本纯化磁珠。单独购买标签接头。

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Discounts:

TruSeq Nano DNA High Throughput Library Prep Kit (96 samples)

20015965

包含用于制备24个文库的试剂和样本纯化磁珠。单独购买标签接头。

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标签接头 (1)

IDT for Illumina – TruSeq DNA UD Indexes v2 (96 Indexes, 96 Samples)

20040870

包含96、8 bp标签,足以标记96个样本,与TruSeq Nano和TruSeq PCR-Free Library Prep Kit兼容。版本 2 包含板 20022370 中 192 个标签寡核苷酸中 8 个的改进,其余 184 个未作更改。单独购买文库制备和探针panel。

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Illumina Advantage产品 (3)

TG TruSeq® Nano DNA LT Sample Prep Kit, Set A (24 Samples)

TG-202-1001

用于24个样本的DNA样本制备的配套试剂,用于单端、双端和多重测序。该试剂盒包含12个唯一单标签。(标签2、4、5、6、7、12、13、14、15、16、18、19)

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TG TruSeq® Nano DNA LT Sample Prep Kit, Set B (24 Samples)

TG-202-1002

用于24个样本的DNA样本制备的配套试剂,用于单端、双端和多重测序。该试剂盒包含12个唯一单标签。(标签 1、3、8、9、10、11、20、21、22、23、25、27)

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TG Truseq® Nano DNA Accessory Kit

TG-280-1001

与TruSeq Nano DNA LT Kit A、B和cfDNA工作流程配合使用的配套试剂盒。一个配套试剂盒通过cfDNA工作流程提供了足够用于4个额外16个样本批次的EPM试剂。

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产品

数量

Unit Price

订购NovaSeq X系列

将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。

MiSeq Reagent Kit v3

经过优化的试剂盒,可提供更高的簇密度和读长,与早期版本相比,提高了测序质量分值。

TruSight Oncology 500

靶向多种变异类型(包括微卫星不稳定性(MSI)和肿瘤突变负荷(TMB))的检测。

Illumina DNA Prep

快速、集成的工作流程,用于制备文库,用于广泛的测序应用。

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