订购NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin采用迅捷高效的测序文库制备工作流程，能从血液来源的总RNA中得到清晰、完整的转录组视图。
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin
11.5小时
分析时间
5.5小时
手动操作时间
0.1–1 ug血液来源的高质量纯化总RNA
起始量
概述
主要特点
一步高效去除核糖体RNA和球蛋白mRNA
对血液来源的RNA进行全转录组分析需要去除两种在全血中含量较高的RNA——核糖体RNA（包括细胞质rRNA和线粒体rRNA）和球蛋白mRNA。
传统去除方法需要两个步骤才能完成。这意味着需要的试剂更多、工作流程更长、损失的RNA更多。TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin利用了Ribo-Zero测序化学技术，能通过一个简单、快速的步骤高效去除两种含量较高的RNA。
自动化工作流程
性能参数
| 作用机制 | 基于磁珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR |
|---|---|
| 内容说明 | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA |
| 分析时间 | 11.5小时 |
| 多重分析 | 高通量试剂盒：使用组合双标签序列或唯一双标签序列制备96个标签样本, 低通量试剂盒：混合最多12个样本。或混合24个样本（组A和B一起） |
| 手动操作时间 | 5.5小时 |
| 物种详情 | rRNA去除：消耗人、小鼠和大鼠rRNA（细胞质和线粒体）和球蛋白mRNA |
| 说明 | 用于血液来源RNA的全转录组测序研究。去除细胞质rRNA、线粒体rRNA和珠蛋白mRNA。 |
| 起始量 | 0.1–1 ug血液来源的高质量纯化总RNA |
所需产品
Illumina现提供模块化产品的预订，让您的工作流程变得灵活。您可以订购带有以下任何标签的以下任何文库制备产品。
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应用
工作流程示例
项目建议
| 仪器 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | RNA Profiling: 6-20 samples per run (based on 20 million reads per sample) |
2×75 bp |
| NovaSeq 6000 System | RNA Profiling (samples per run, dual flow cell): S1: 160, S2: 320, S4: 768. Limited by index combinations (dual). Based on 20 million reads. |
≤ 2 × 100 bp |
相关应用和方法
分析编码RNA和多种形式的非编码RNA，获得完整的转录组视图。
查找从降解的FFPE组织和其他低质量样本中获得高质量结果的FFPE RNA测序解决方案。
RNA-Seq使用新一代测序技术分析全转录组的表达，使研究人员能够检测已知或新的特性并对RNA进行定量。
文档
Support documentation
- TruSeq Stranded Total RNA Sample Preparation User-Supplied Consumables and Equipment 文档
- TruSeq Stranded Total RNA Consumables & Equipment 文档
- TruSeq Stranded Total RNA With Illumina Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Reference Guide 文档
- Sequencing Library qPCR Quantification Guide 文档
- Illumina Experiment Manager User Guide 文档
- TruSeq Stranded Total RNA Dual Index Product Insert 文档
- TruSeq Stranded Total RNA Documentation 文档
- TruSeq Stranded Total RNA Reference Guide 文档
- TruSeq Stranded Total RNA Sample Prep HS EUC and LTF 文档
- TruSeq Sample Prep Best Practices Guide 文档
- TruSeq Stranded Total RNA Sample Preparation LS EUC and LTF 文档
- TruSeq Stranded Total RNA Sample Prep Guide 文档
- TruSeq HT Dual Index Quick Reference Card 文档
- TruSeq Stranded Total RNA Checklist 文档
- 全部 TruSeq Stranded Total RNA Support
- 全部 TruSeq Stranded Total RNA支持——文档和文献 Support
比较
| TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin | Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus或Ribo-Zero Plus Microbiome | |
|---|---|---|
| Automation capability | Liquid Handling Robots | Liquid Handling Robots |
| Method | Whole-Transcriptome Sequencing | Whole-Transcriptome Sequencing, Metatranscriptome Sequencing |
| Specialized sample types | Blood | Microbiome Samples, Low-Input Samples, FFPE Tissue |
| Variant class | Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Novel transcripts | Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Novel transcripts |
| 作用机制 | 基于磁珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR | 酶法rRNA去除，连接接头和标签 |
| 内容说明 | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA |
| 分析时间 | 11.5小时 | 约7小时 |
| 多重分析 | 高通量试剂盒：使用组合双标签序列或唯一双标签序列制备96个标签样本, 低通量试剂盒：混合最多12个样本。或混合24个样本（组A和B一起） | 多达384个唯一双标签（UDI） |
| 手动操作时间 | 5.5小时 | ＜3小时 |
| 技术 | Illumina测序 | Illumina测序 |
| 核酸类型 | RNA | RNA |
| 物种 | 小鼠, 人, 大鼠 | 小鼠, 人, 大鼠, Bacteria |
| 物种详情 | rRNA去除：消耗人、小鼠和大鼠rRNA（细胞质和线粒体）和球蛋白mRNA |
Ribo-Zero Plus可去除多个物种的大量转录本，包括：人类细胞质和线粒体rRNA、小鼠rRNA、大鼠rRNA、细菌（大肠杆菌和枯草芽孢杆菌）rRNA以及人类β珠蛋白转录本 Ribo-Zero Plus Microbiome去除了多个物种的大量转录本，包括：在Ribo-Zero Plus中去除的转录本以及多种微生物物种和ATCC MSA-2002, MSA-2005和MSA-2006 |
| 系统 | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| 说明 | 用于血液来源RNA的全转录组测序研究。去除细胞质rRNA、线粒体rRNA和珠蛋白mRNA。 |
用于从低RNA起始量和低质量样本制备全转录组测序文库，支持多种RNA-Seq应用。包括Ribo-Zero Plus，用于单管去除来自多个物种的rRNA和珠蛋白RNA，以便进行丰富的转录组分析。 |
| 起始量 | 0.1–1 ug血液来源的高质量纯化总RNA |
标准质量RNA样本为1–1000 ng总RNA。建议至少10 ng总RNA，以获得最佳性能和FFPE样本 |
图
技术平行分析
FFPE组织的技术平行分析显示出高度的一致性，表明文库制备的性能稳定。轴为log2(FPKM)。显示 R2 值。
均匀覆盖转录本
TruSeq Stranded Total RNA在新鲜冷冻（FF，上图）和FFPE（下图）肿瘤以及匹配正常乳腺组织中的前1，000个表达转录本中具有出色的覆盖度，比对链read＞98%。X轴：转录本的不同位置，Y轴：结合read的覆盖度百分比。
文库制备 (2)
TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Globin (48 Samples)
20020612
包括用于从血液样本中去除rRNA和球蛋白mRNA的RiboZero磁珠、用于将RNA转录成cDNA的PCR预混液，以及用于制备48个样本的试剂。单独购买标签接头和纯化磁珠。
List Price:
Discounts:
TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Globin (96 Samples)
20020613
包括用于从血液样本中去除rRNA和球蛋白mRNA的RiboZero磁珠、用于将RNA转录成cDNA的PCR预混液，以及用于制备48个样本的试剂。单独购买标签接头和纯化磁珠。
List Price:
Discounts:
标签接头 (5)
TruSeq RNA CD Index Plate (96 Indexes, 96 Samples)
20019792
TruSeq Stranded RNA HT Kit 96样本接头孔板盒
List Price:
Discounts:
TruSeq RNA Single Indexes Set A (12 Indexes, 48 Samples)
20020492
包括24个标签中的12个（标签：2、4、5、6、7、12、13、14、15、16、18、19），用于制备48个单独的RNA样本。
List Price:
Discounts:
TruSeq RNA Single Indexes Set B (12 Indexes, 48 Samples)
20020493
包括24个标签中的12个（标签：1、3、8、9、10、11、20、21、22、23、25、27），用于制备48个单独的RNA样本。
List Price:
Discounts:
IDT for Illumina – TruSeq RNA UD Indexes (24 Indexes, 96 Samples)
20020591
唯一双重标签（UDI），与TruSeq Stranded mRNA和TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kit兼容。UDI试剂盒以孔板形式供货，包含24个UDI（x4），足够用于96个样本。
IDT for Illumina – TruSeq RNA UD Indexes (96 Indexes, 96 Samples)
20022371
唯一双重标签（UDI），与TruSeq Stranded mRNA和TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kit兼容。UDI试剂盒以孔板形式供货，包含96个UDI，足够用于96个样本。
List Price:
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MiSeq Reagent Kit v3
经过优化的试剂盒，可提供更高的簇密度和读长，与早期版本相比，提高了测序质量分值。
TruSight Oncology 500
靶向多种变异类型（包括微卫星不稳定性（MSI）和肿瘤突变负荷（TMB））的检测。
Illumina DNA Prep
快速、集成的工作流程，用于制备文库，用于广泛的测序应用。
NextSeq 500/550 v2.5 Kit
试剂v2.5试剂盒使用弹性流动槽，该流动槽可保持起始荧光强度，与早期版本相比提高了稳定性和性能。
TruSight Hereditary Cancer Panel
用于评估113个基因和125个与遗传癌症风险易感性相关的SNP的生殖系突变的靶向测序panel。
TruSeq Stranded mRNA
从mRNA制备测序文库，获得清晰的编码转录组视图以及链特异性信息。
TruSeq Stranded Total RNA
可靠的、扩展自如的全转录组分析（RNA-Seq）解决方案适用于各种物种与样本类型，包括人类、小鼠与福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本。
TruSeq RNA Exome
为FFPE组织及其他低质量样本的RNA测序提供的可重现且经济的解决方案。只需10 ng的总RNA即可保证精确度。
Illumina RNA Prep with Enrichment
一种快速、集成的工作流程，用于从各种样本类型和RNA起始量中制备富集和标签测序文库。
标签使用有限许可：
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin工作流程的产品及其使用受Max Planck Gesellschaft所拥有且独家授权给New England Biolabs, Inc.并再授权给Illumina, Inc.的一个或多个已公告和/或待批准的美国和外国专利申请的约束。向Illumina, Inc.、其关联机构或其授权经销商和分销商购买此产品，即向买方转让使用买方所购数量产品和产品组件的权利（不论买方是学术性还是盈利性实体），该权利不可转让。购买此产品并不会转让前述专利或专利申请中针对产品生产的任何权利要求项下的许可。买方不得向第三方出售或以其他方式转让此产品及其组件，亦不得以其他方式将此产品用于下商业用途：（1）在生产中使用此产品或其组件；或（2）出于治疗或预防疾病的目的，在人或动物身上使用此产品或其组件。
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