扩增子测序
扩增子测序简介
扩增子测序是一种高度靶向的方法，能让研究人员分析特定基因组区域的遗传变异。PCR产物（扩增子）的超深度测序可以有效地识别并表征变异。该方法采用寡核苷酸探针来靶向并捕获感兴趣的区域，随后再进行新一代测序（NGS）。
扩增子测序有助于发现复杂样本（如混有生殖系DNA的肿瘤）中的罕见体细胞突变。另外一种常见应用是对多物种的细菌16S rRNA进行测序，这是系统发育和分类研究中广泛采用的方法，特别是在多样化的宏基因组学样本中。
扩增子测序的优势
- 采用高度靶向的方法，能让研究人员高效地发现、验证和筛选遗传变异
- 每次反应能进行成百上千个扩增子的多重分析，可实现高覆盖度
- 即使在难以测序的区域，例如高GC区域，也能提供高度靶向的重测序
- 非常灵活，可应用于广泛的实验设计
- 与全基因组测序等范围更广的方法相比，可减少测序成本和周转时间
高度靶向的多重分析
扩增子测序可让研究人员在单次运行中对几个到数百个目标基因进行测序。这种超高多重PCR方法可通过同时评估多个基因来加速研究。只需5–7.5小时就可以完成文库制备，17–32小时就可以完成测序。
扩增子测序可支持发现、验证或筛查遗传变异的各种研究应用。
推荐的扩增子测序工作流程
内容选择与文库制备
DesignStudio定制实验分析设计器
基于网页的定制检测设计工具。
AmpliSeq for Illumina Custom DNA Panel
专为特异性靶点或感兴趣的基因组内容进行优化的靶向定制研究panel。
全面的扩增子测序工作流程
Illumina边合成边测序（SBS）技术是最广泛采用的NGS技术，产生了全世界约90%的测序数据。*
Illumina提供了集成的扩增子测序工作流程，简化了从文库制备到数据分析和生物学解读的整个过程。
点击下方的查看工作流程各步骤所使用的产品。
AmpliSeq for Illumina测序解决方案
提供多种随时可用panel和定制panel，以进行简单、灵活的靶向重测序，提供可以信任的高质量数据。
TruSight Myeloid Sequencing Panel预设计的研究panel，靶向血癌中频繁突变的54个基因。
Nextera DNA Flex Library Prep Kit一个快速、集成的工作流程，适合广泛的应用，从人类全基因组测序到扩增子、质粒和各种微生物。
TruSight Tumor 15这款靶向测序研究panel可在单次检测中以简便快速的工作流程评估实体瘤中的15个常见突变基因。
Nextera XT DNA Library Prep Kit
90分钟内即可完成小型基因组（细菌、古细菌、病毒）、扩增子和质粒的文库制备。
癌症研究panel产品系列Illumina靶向测序panel提供了专家定义的基因内容及简单的数据分析和报告选项来促进临床癌症研究。
文库制备试剂盒选择器根据您的项目类型、起始材料、方法或应用，确定满足您需求的最佳试剂盒。
DesignStudio实验分析设计工具一款易于使用的在线软件工具，可提供动态反馈来优化探针设计。
iSeq 100系统
具有经济实惠，快速且触手可及的测序能力，可在任何实验室进行靶向或小型基因组测序。
MiniSeq系统支持广泛的靶向DNA和RNA应用，可用于检测单个基因或整条通路。
MiSeq系统支持重点应用，从靶向重测序到宏基因组学、小基因组测序等。
NextSeq 550系统提供了全基因组、转录组和靶向重测序所需的灵活功能。
BaseSpace Sequence Hub
用于NGS数据分析和管理的Illumina基因组学计算环境。
Local Run Manager可以创建测序运行、监测运行状态和分析数据的本地软件解决方案。
TruSeq Amplicon App采用TruSeq Amplicon read简化特定靶序列富集的NGS数据分析过程。
16S Metagenomics App通过对原核16S小亚基rRNA基因进行扩增子测序来分析DNA，并提供关于分类学分类的信息。
Integrative Genomics Viewer App
由哈佛及麻省理工Broad研究所开发的基因组浏览器，可以显示用于复杂变异分析的NGS数据。
BaseSpace Variant Interpreter利用领先的注释数据库和强大的筛选界面，让研究人员快速地识别疾病相关变异。
BaseSpace Correlation Engine不断增长的经审核的基因组数据库，可在鉴定疾病机制、药物靶点和生物标记方面为研究人员提供有力支持。
借助MiniSeq台式测序仪发挥靶向测序的力量
借助小巧、可靠的MiniSeq系统为低通量应用提供Illumina NGS的成熟性能。使用适合您的实验室空间、预算和工作流程的测序解决方案来研究单个基因或整条通路。
查看系统
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更多资源
在iSeq 100系统上使用的AmpliSeq for Illumina
了解能帮助您将工作流程迁移到在iSeq 100系统上使用的AmpliSeq for Illumina panel的分步操作指南。
*根据Illumina公司2015年存档数据计算