Tagmentation

采用On-bead Tagmentation技术缩短文库制备用时

整合了DNA提取、片段化、文库制备和文库归一化的新测序化学技术

什么是酶切法片段化(Tagmentation)?

酶切法片段化是文库制备的第一步,该步骤会将DNA片段化并添加标签,以便用于分析。

On-bead Tagmentation文库制备采用了连接磁珠的转座酶,与在游离状态下进行的酶切法片段化反应相比,该技术可实现更均一的酶切法片段化反应。连接磁珠的转座酶测序化学技术整合了DNA提取、片段化、文库制备和文库归一化步骤。这有助于简化工作流程,减少所需的样本起始量,缩短手动操作时间和周转时间。

On-Bead Tagmentation的工作原理

了解连接磁珠的转座酶技术如何整合和简化工作流程。

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为何On-Bead Tagmentation的效果更佳

与在游离状态下进行的酶切法片段化相比,使用连接磁珠的转座酶进行文库制备的优势包括:

  • 需要的样本起始量低
  • 无需进行文库定量和归一化,周转时间和手动操作时间更短
  • On-bead fragmentation无需进行DNA剪切
  • 在较宽的DNA起始量范围内实现均匀且大小一致的插入片段和文库产量

在缩短文库制备时间的同时,On-bead tagmentation技术可以提供大小一致的插入片段、均一的覆盖度和优化的性能,不论DNA起始量或基因组大小如何。

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提高实验的灵活性

On-bead tagmentation文库制备支持较宽的DNA起始量范围,为各种样本类型(包括珍贵样本)的实验提供了灵活性。该技术非常适合用于人类全基因组测序、癌症基因组学研究、环境宏基因组学、传染性疾病研究、农业基因组学等领域的应用:

  • 任何物种(大型或小型)的全基因组DNA测序
  • 不使用唯一分子标记的靶向DNA富集应用,包括全外显子组测序、固定基因集的panel、定制panel,以及Illumina和第三方寡核苷酸供应商提供的应用
  • RNA富集
全新的文库制备技术

了解Illumina DNA Prep(原名为Nextera DNA Flex)如何使用全新的on-bead tagmentation技术,在弥补酶切法片段化不足的同时保留其便利性。

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应用 产品 优势
16s rRNA测序、扩增子测序、从头测序、鸟枪法测序、全基因组测序 Nextera XT
  • 针对小基因组、PCR扩增子和质粒研究进行了优化
扩增子测序、从头测序、鸟枪法测序、全基因组测序 Illumina DNA Prep
  • 无需对文库进行定量
人类全基因组测序 Illumina DNA PCR-Free
  • 连接磁珠的转座酶技术
  • 避免了PCR重复
  • 无需对文库进行定量

比较Nextera与TruSeq技术

Nextera采用连接磁珠的转座酶技术。该方案整合了DNA提取、自动化的片段化、文库制备和文库归一化,非常适合用于全基因组测序及靶向富集应用。

TruSeq采用了接头连接、片段化、末端修复,能有效进行Poly(A)捕获。但它需要单独进行DNA剪切。该技术可捕获编码转录组,是全转录组RNA-Seq、外显子组富集、大规模全基因组重测序、靶向重测序、从头测序、宏基因组学和甲基化研究的理想选择。

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自动化

我们的合作伙伴已经开发了高通量和低通量的自动化方法,可用于我们的文库制备产品系列。

标签接头

使用唯一双标签接头增加每次运行的样本数量,并优化高通量测序。

UMIs

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