订购NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
COVIDSEQ Assay（96样本）是一种全面的基于扩增子的新一代测序（NGS）检测，旨在帮助研究实验室鉴定新的SARS-CoV-2变异。
COVIDSeq Assay（96个样本）
这种中低通量NGS检测使任何规模的实验室都能识别和追踪新型SARS-CoV-2变异的出现和流行。
概述
快速、经济高效的测序
COVIDSeq Assay（96个样本）旨在运行少量样本，提供适用于Illumina台式测序系统的低通量配置，使小型实验室能够对新变异进行分散监测。
均匀的基因组覆盖
覆盖范围集中在刺突蛋白位点。为了获得详细的测序，可选的ARTIC v4引物池可对新变异进行深入的表征。
集成解决方案
试剂盒包含用于cDNA转化、扩增和文库制备的所有试剂。PCR过程中的退火温度为63°°C，可改善变异分析和见解。
简化的数据分析
使用开放软件工具评估谱系并注释突变，包括BaseSpace Sequence Hub中的DRAGEN COVID谱系应用程序。
性能参数
| Automation capability | Liquid Handling Robots |
|---|---|
| Method | Targeted RNA Sequencing, Amplicon Sequencing |
| Strand specificity | Non-Stranded |
| 内容说明 |
跨刺突蛋白位点的统一病毒基因组覆盖度 |
| 多重分析 |
iSeq系统上8重 MiSeq系统上30–48重 MiniSeq系统上的48重 |
| 技术 | Illumina测序 |
| 样本类型详细信息 |
鼻咽、口咽和中鼻甲鼻拭子样本 |
| 核酸类型 | RNA |
| 物种 | 人, Virus |
| 物种详情 | SARS-CoV-2（SARS-CoV-2_ MN908947v3） |
| 系统 | MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq 6000Dx in Research Mode, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System |
| 自动化详情 | 探索可用的自动化方法 |
| 说明 | COVIDSeq Assay（96样本）是一种中低通量NGS检测，可在任何Illumina台式测序系统上处理，用于研究应用。 |
所需产品
需要一次COVIDSeq检测（96样本）。除了随附的标签板外，共有四个选项。
COVIDSeq阳性对照是可选产品。
Illumina COVIDSeq v4引物池，384个样本RUO是v3引物池的可选替代产品。v4针对Delta和Omicron变异中的其他突变进行了更新，提高了刺突蛋白位点的覆盖度。
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应用
COVIDSeq Assay（96样本）使实验室能够使用台式测序系统对SARS-CoV-2变异和谱系进行基因组监测，以鉴定和监测新毒株。
工作流程示例
相关应用和方法
NGS can identify novel coronavirus variants, track COVID-19 transmission, and more. Compare NGS methods for various coronavirus sequencing goals.
NGS supports effective genomic surveillance strategies through identification of novel strains of coronavirus and other emerging infectious disease agents.
基因组学可以通过检测和鉴定新的、新兴的和循环的病原体来促进公共卫生和健康。
比较
| COVIDSeq Assay（96个样本） | COVIDSeq检测（研究版本） | Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit | Pan-Coronavirus Panel | |
|---|---|---|---|---|
| Automation capability | Liquid Handling Robots | Liquid Handling Robots | Liquid Handling Robots | Liquid Handling Robots |
| Method | Targeted RNA Sequencing, Amplicon Sequencing | Targeted RNA Sequencing, Amplicon Sequencing | Target Enrichment, Targeted RNA Sequencing, Targeted DNA Sequencing | Target Enrichment, Whole-Genome Sequencing |
| Strand specificity | Non-Stranded | Non-Stranded | Non-Stranded | |
| 内容说明 |
跨刺突蛋白位点的统一病毒基因组覆盖度 |
跨刺突蛋白位点的统一病毒基因组覆盖度 |
同时检测呼吸道病原体DNA和RNA，同时分析抗菌药物耐药性（AMR）基因表达。 | |
| 多重分析 |
iSeq系统上8重 MiSeq系统上30–48重 MiniSeq系统上的48重 |
NextSeq上的384重 NovaSeq上的384重 |
使用唯一双标签，单次运行最多可分析384个样本 | 使用唯一双标签，单次运行最多可分析384个样本 |
| 技术 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 |
| 样本类型详细信息 |
鼻咽、口咽和中鼻甲鼻拭子样本 |
鼻咽、口咽和中鼻甲鼻拭子样本 |
||
| 核酸类型 | RNA | RNA | DNA, RNA | RNA |
| 物种 | 人, Virus | 人, Virus | Fungal, Virus, Bacteria | Virus |
| 物种详情 | SARS-CoV-2（SARS-CoV-2_ MN908947v3） | SARS-CoV-2（SARS-CoV-2_ MN908947v3） | 检测呼吸道病原体（180多种细菌、50多种真菌和40多种病毒，包括SARS-CoV-2）和抗菌药物耐药性等位基因（1200多种）。 | |
| 系统 | MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq 6000Dx in Research Mode, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System | MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq 6000Dx in Research Mode, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System | MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, MiniSeq System | MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeq System |
| 自动化详情 | 探索可用的自动化方法 | 探索可用的自动化方法 | 探索可用的自动化方法 | |
| 说明 | COVIDSeq Assay（96样本）是一种中低通量NGS检测，可在任何Illumina台式测序系统上处理，用于研究应用。 |
COVIDSeq检测（RUO版本）是一种可扩展的高通量NGS检测（多达3072个样本），适用于研究应用。 |
鉴定呼吸道感染和合并感染，检测抗菌药物耐药性标志物，并对关键病原体（SARS-CoV-2和Flu A/B病毒）进行菌株分型，以研究病毒的进化和传播。 | Pan-Coronavirus Panel是集成工作流程的一部分，可用于检测和全基因组测序各种动物宿主中的200多种已知和新型冠状病毒菌株。 |
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图
基因组覆盖性能
热图绘制性能随读长和深度的变化，与单端读长相比，双端读长显著改善。显示了>0.99可信度的基因组比例，接近1的值代表SARS-CoV-2基因组的更完整覆盖度。
文库制备 (4)
COVIDSeq Assay (96 samples) index 1
20049393
包含用于制备96个样本以检测SARS-CoV-2的试剂。包括带96个唯一双标签的标签板1。单独购买可选的阳性对照和可选的v4引物池
List Price:
Discounts:
COVIDSeq Assay (96 samples) index 2
20051772
包括用于制备96个样本的试剂，用于检测SARS-CoV-2。包括带96个唯一双标签的标签板2。单独购买可选的阳性对照和可选的v4引物池
List Price:
Discounts:
COVIDSeq Assay (96 samples) index 3 RUO
20051773
包括用于制备96个样本的试剂，用于检测SARS-CoV-2。包括带96个唯一双标签的标签板3。单独购买可选的阳性对照和可选的v4引物池
List Price:
Discounts:
COVIDSeq Assay (96 samples) index 4 RUO
20051774
包括用于制备96个样本的试剂，用于检测SARS-CoV-2。包含标签板4，带有96个唯一双标签。单独购买可选的阳性对照和可选的v4引物池
List Price:
Discounts:
配套产品 (2)
COVIDSeq Positive Control
20051775
包含100 uL COVIDSeq阳性对照，用于支持质量控制
List Price:
Discounts:
Illumina COVIDSeq v4 Primer Pools, 384 Samples RUO
20065135
包含可选的ARTIC v4引物池试剂，可用于多达384个样本。取代COVIDSeq检测（RUO）和COVIDSeq检测（96个样本）中包含的v3引物池。
List Price:
Discounts:
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常见问题解答
主要区别在于每次检测可以运行的样本数量。COVIDSeq Assay（96个样本）可在Illumina台式测序系统上运行多达96个样本，以适应规模较小的研究实验室。相比之下，COVIDSeq Test（RUO）可在NovaSeq 6000系统或NextSeq系列测序系统上运行多达3072个样本。
制备好的文库可在任意因美纳测序系统上测序。然而，COVIDSeq Assay（96）样本的低通量配置非常适合Illumina台式测序系统，包括iSeq 100、MiniSeq、MiSeq、NextSeq 550、NextSeq 1000和NextSeq 2000系统。
ARTIC v3引物池包含在COVIDSeq Assay（96样本）试剂盒中。它包含98个扩增子和11个人类基因的引物，针对SARS-CoV-2的原始菌株设计。可选的ARTIC v4引物池包括99个扩增子，不含人类对照，针对Delta变异设计。它提高了刺突蛋白位点的基因组覆盖度，并提高了SARS-CoV-2变异检测的分析灵敏度。
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MiSeq Reagent Kit v3
与早期版本相比，优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
TruSight Oncology 500
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
COVIDSeq检测（研究版本）
这种高通量NGS检测使实验室能够检测SARS-CoV-2突变，以识别和追踪新变异的出现和流行。
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit
文库制备和富集试剂盒，可提供高度灵敏、全面的呼吸道病原体鉴定和抗菌素耐药性见解。
Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit
简化的工作流程可对包括SARS-CoV-2毒株在内的常见呼吸道病毒进行高度灵敏的检测和表征。
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