产品

AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel

AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel

用于测定20,000多个人类RefSeq基因的表达水平的靶向panel。

6小时（仅包括文库制备时间；不包括文库定量、归一化或混合时间）

分析时间

< 1.5小时

手动操作时间

1-100 ng RNA（推荐10 ng）

起始量

详情请参见规格表

概述

AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel是一种高度多重的靶向重测序分析套装，可在单次分析中测定20,000多个人类RefSeq基因的表达水平。

主要特点

  • 快速的基因表达图谱分析——在6小时内制备文库，手动操作时间＜1.5小时；结果在＜2天内可用。

  • 低质量、低量样本起始量——即使从福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织的起始量最少，也能获得高质量数据。

  • DNA-to-Analysis Solution —— 利用涵盖文库制备、测序和分析的全面工作流程。

Transcriptome Human Gene Expression Panel是集成工作流程的一部分，该工作流程包括基于AmpliSeq for Illumina聚合酶链式反应（PCR）的文库制备、采用因美纳边合成边测序（SBS）的新一代测序（NGS）技术以及自动化分析过程。

即用型panel助您节省鉴定目标基因、设计引物和优化panel所需的时间和精力。

深入了解AmpliSeq for Illumina

性能参数

Method Targeted RNA Sequencing, mRNA Sequencing, Exome Sequencing
Specialized sample types FFPE Tissue, Blood
Variant class Transcript variants
作用机制 多重PCR
内容说明 > 95%的人类RefSeq基因；20,802个基因；捕获人类转录组
分析时间 6小时（仅包括文库制备时间；不包括文库定量、归一化或混合时间）
多重分析 96个双标签序列组合
手动操作时间 < 1.5小时
扩增子数 一个混合池
技术 Illumina测序
核酸类型 RNA
物种 人
系统 NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System
说明 使用序列特异性扩增子研究超过20,000个人类RefSeq基因的表达水平。
起始量 1-100 ng RNA（推荐10 ng）

所需产品

AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel工作流程需要Transcriptome Panel、Library PLUS试剂盒和标签接头。 RNA工作流程还需要cDNA合成。

/

应用

工作流程示例

1
制备

AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel

2
测序
3
分析

相关应用和方法

靶向重测序

通过定向重测序，可以将一个基因子集或基因组区域分离出来并进行测序，从而节省实验室资源。

癌症RNA测序

利用RNA新一代测序（RNA-Seq）检测癌症基因表达和转录组变化，鉴定新的癌症转录本。

mRNA测序

使用NGS的mRNA测序（mRNA-Seq）可以鉴定已知和新型转录本，并测定转录本丰度。

文档

产品资料
支持文档

比较

AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus或Ribo-Zero Plus Microbiome TruSeq Stranded Total RNA TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin
Method Targeted RNA Sequencing, mRNA Sequencing, Exome Sequencing Whole-Transcriptome Sequencing, Metatranscriptome Sequencing Whole-Transcriptome Sequencing Whole-Transcriptome Sequencing
Variant class Transcript variants Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Novel transcripts Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Novel transcripts Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Novel transcripts
作用机制 多重PCR 酶法rRNA去除，连接接头和标签 基于磁珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR 基于磁珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR
内容说明 > 95%的人类RefSeq基因；20,802个基因；捕获人类转录组 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA
分析时间 6小时（仅包括文库制备时间；不包括文库定量、归一化或混合时间） 约7小时 11.5小时 11.5小时
手动操作时间 < 1.5小时 ＜3小时 5.5小时 5.5小时
扩增子数 一个混合池
技术 Illumina测序 Illumina测序 Illumina测序 Illumina测序
核酸类型 RNA RNA RNA RNA
物种 人 小鼠, 人, 大鼠, Bacteria 小鼠, 人, 大鼠 小鼠, 人, 大鼠
说明 使用序列特异性扩增子研究超过20,000个人类RefSeq基因的表达水平。

用于从低RNA起始量和低质量样本制备全转录组测序文库，支持多种RNA-Seq应用。包括Ribo-Zero Plus，用于单管去除来自多个物种的rRNA和珠蛋白RNA，以便进行丰富的转录组分析。 

 用于全转录组测序研究。Total RNA版本可去除细胞质rRNA，而Total RNA Gold版本可去除细胞质和线粒体rRNA。 用于血液来源RNA的全转录组测序研究。去除细胞质rRNA、线粒体rRNA和珠蛋白mRNA。
起始量 1-100 ng RNA（推荐10 ng）

标准质量RNA样本为1–1000 ng总RNA。建议至少10 ng总RNA，以获得最佳性能和FFPE样本 

 0.1 – 1 ug高质量总RNA。低质量样本可能需要进一步优化。 0.1–1 ug血液来源的高质量纯化总RNA

Panel (1)

AmpliSeq™ Transcriptome Human Gene Expression Panel for Illumina®

20019170

与AmpliSeq Library PLUS for Illumina搭配使用时，足以进行24次反应。单独购买文库制备、标签接头和配套产品。

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文库制备 (3)

AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®

20019101

包含用于制备24个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。

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AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®

20019102

包含用于制备96个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。

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AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®

20019103

包含用于制备384个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。

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标签接头 (6)

AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24 Indexes, 24 Samples)

20019104

包含足以标记24个样本的24个标签。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®

20019105

包含96个标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®

20019106

包含96个标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®

20019107

包含96个标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®

20019167

包含96、8 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂和探针panel。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples)

20031676

包含四组AmpliSeq CD Indexes for Illumina、Set A、Set B、Set C和Set D。每组包含96、8 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和探针panel。

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配套产品 (4)

Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®

20022654

使用AmpliSeq for Illumina RNA Panel（例如，AmpliSeq for Illumina Immune Response、Immune Repertoire Plus、TCR beta Panel、Myeloid、Transcriptome Human Gene Expression、Focus和 Comprehensive Panel v3以及定制或社区RNA Panel）时，包含反应混合物和酶混合物，可将总RNA转化为cDNA。反应次数因panel而异（例如，AmpliSeq for Illumina Immune Response、Focus、 Comprehensive Panel v3和Custom Panel的每个试剂盒有100次反应，AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression、Myeloid、Immune Repertoire Plus和TCR beta Panel的每个试剂盒有200次反应）。

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AmpliSeq™ for Illumina® Sample ID Panel

20019162

与AmpliSeq Library PLUS for Illumina搭配使用时，包含8个单核苷酸多态性（SNP）靶向引物对和1个性别区分引物对，足以进行96次反应。实现快速准确的样本鉴定。单独购买文库制备、探针panel和标签接头。

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AmpliSeq™ for Illumina® Direct FFPE DNA

20023378

包括24次反应，用于使用AmpliSeq for Illumina实验方案从未染色的玻片固定FFPE组织中制备DNA，无需脱蜡或DNA纯化。

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AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®

20019171

在制备用于测序的AmpliSeq for Illumina文库时，包含用于文库归一化的磁珠和试剂。

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快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。

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