We recommend ordering the new Illumina RNA UD Indexes Sets A-D (20091655, 20091657, 20091659, 20091661). The IDT for Illumina RNA UD Indexes Sets A-D (20040553, 20040554, 20040555, 20040556) are obsolete and the last order date is January 30, 2025, as announced in PON2023-1440.
Illumina Stranded mRNA Library Prep培训
20044765
Illumina Stranded mRNA Prep提供了简化的RNA-Seq解决方案,可获得全转录组的清晰、全面分析。还可灵活地支持多种输入类型和起始量(最低低至25 ng总RNA)。Illumina Stranded mRNA Prep能够精确测量链方向,实现均匀覆盖,并发现高度可信的新亚型、基因融合和等位基因特异性表达等特征。
Illumina Stranded mRNA Prep经过优化,可提供出色的polyA捕获效率和覆盖均一性。它极大减少了准确、无偏差地检测编码转录组所需的测序深度。Illumina Stranded mRNA Prep基于TruSeq连接技术,自2011年起已被至少9926篇文献引用。
Illumina Stranded Total RNA Prep支持较宽的RNA起始量范围(25 ng–1000 ng)。*
此信息可支持检测反义转录、增强转录本注释和提高比对效率。
7小时内即可制备好用于测序的文库。我们将通过自动化合作伙伴提供Illumina认证的自动化选项。
在单次运行中可多重分析最多384个样本。(Index Set A和B已上市,Set C和D即将推出。)
RNA-Seq正逐渐成为业界思想领袖的理想平台,可以快速呈现转录组在特定时间点的详细快照。与定量PCR相比具有很多优势,包括:
*与FFPE样本不兼容
仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
---|---|---|
NextSeq 550 System | 中通量: 5 高通量: 16 (基于每个样本25 M reads) |
2 × 75 bp |
NextSeq 2000 System | P2: 16 P3: 40 (基于每个样本25 M reads) |
2 × 75 bp |
NovaSeq 6000 System | SP: 32 S1: 64 S2: 164 S4: 384 (基于每个样本25 M reads) |
2 × 75 bp |
Illumina Stranded mRNA Prep | TruSeq Stranded mRNA | TruSeq RNA Library Prep Kit v2 | Illumina RNA Prep with Enrichment | Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus or Ribo-Zero Plus Microbiome | |
---|---|---|---|---|---|
作用机制 | PolyA捕获,连接接头和标签 | 寡核苷酸-dT微珠捕获polyA尾巴 | 寡核苷酸-dT微珠捕获polyA尾巴 | 连接磁珠的转座酶 | 酶法rRNA去除,连接接头和标签 |
内容说明 | 捕获编码转录组(带链信息) | 捕获编码转录组(带链信息) | 捕获编码转录组(无链信息) | 与Illumina Exome Panel一起使用时可捕获编码转录组 | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA。 |
变异种类 | 新型转录本, 转录变异, 基因融合, 单核苷酸多态性 (SNPs) | 新型转录本, 转录变异, 基因融合, 单核苷酸多态性 (SNPs) | 新型转录本, 转录变异, 基因融合, 单核苷酸多态性 (SNPs) | 新型转录本, 转录变异, 基因融合, 单核苷酸多态性 (SNPs) | 新型转录本, 转录变异, 基因融合, 单核苷酸多态性 (SNPs) |
多重分析 | 多达384个唯一双标签序列(UDI) | 1–96 | 每道多达24-plex | 多达384个唯一双标签序列(UDI) | 多达384个唯一双标签序列(UDI) |
手动操作时间 | <3小时 | 约4.5小时 | 约4.5小时 | <2小时 | <3小时 |
技术 | 测序 | 测序 | 测序 | 测序 | 测序 |
核酸类型 | RNA | RNA | RNA | RNA | RNA |
物种类别 | 牛, 哺乳动物, 大鼠, 小鼠, 人类 | 牛, 哺乳动物, 大鼠, 小鼠, 人类 | 人类, 牛, 哺乳动物, 大鼠, 小鼠 | 病毒, 人类 | 细菌, 大鼠, 小鼠, 人类 |
特殊的样本类型 | Not FFPE-Compatible, 低起始量样本 | 不兼容FFPE | 不兼容FFPE | 低起始量样本, 血液, FFPE组织 | |
系统兼容性 | NovaSeq X, HiSeq 4000, HiSeq 3000, NextSeq 1000, NextSeq 500, NextSeq 2000, NovaSeq 6000, NextSeq 550 | Genome Analyzer IIx, NovaSeq X, HiSeq 4000, HiSeq 3000, NextSeq 1000, NextSeq 500, NextSeq 2000, MiSeq, NovaSeq 6000, NextSeq 550 | Genome Analyzer IIx, HiSeq 4000, HiSeq 3000, NextSeq 500, MiSeq, NextSeq 550 | NovaSeq X, HiSeq 4000, HiSeq 3000, iSeq 100, NextSeq 1000, MiniSeq, NextSeq 500, NextSeq 2000, MiSeq, NovaSeq 6000, NextSeq 550 | NovaSeq X, HiSeq 4000, HiSeq 3000, NextSeq 1000, NextSeq 500, NextSeq 2000, NovaSeq 6000, NextSeq 550 |
说明 | 简单、经济的编码转录组分析解决方案,可提供精确的链信息 | 简单、经济的编码转录组分析解决方案,可提供精确的链信息 | 简单、经济的编码转录组分析研究解决方案。 | 一种可重现且经济的解决方案,可使用多种类型的样本和起始材料来检测和发现目标转录本,包括福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织和其他低质量样本 | 用于多种类型样本的全转录组测序研究。包含Ribo-Zero plus模块,一个试管即可去除多个物种的转录本。 |
起始量 | 25-1000 ng标准质量的总RNA | 0.1–1 ug 总RNA或10 - 100 ng先前分离的mRNA(来自带polyA尾巴的种系) | 0.1-1 μg总RNA或10-400 ng先前分离的mRNA(来自带polyA尾巴的种系) | 10 ng新鲜/冷冻样本来源的总RNA,或20 ng FFPE样本来源的总RNA | 对于标准质量RNA样本,可使用1–1000 ng的总RNA。对于FFPE样本,建议最少使用10 ng的总RNA,以获得理想效果。 |
链特异性 | 链状 | 链状 | 非链状 | 非链状 | 链状 |
Brochure | PDF 1 MB
Illumina library preparation solutions
Brochure | PDF 2 MB
NextSeq 1000 and NextSeq 2000 RNA sequencing solution
Application Note | PDF < 1 MB
Application Note | PDF < 1 MB
Best practices for read trimming for Illumina Stranded mRNA and Total RNA workflows
Technical Note | PDF < 1 MB
Data Sheet | PDF | 5 versions
Illumina Stranded mRNA Prep Ligation Documentation
Illumina Stranded mRNA Prep Ligation Checklist Documentation
Illumina Stranded mRNA Prep Ligation Reference Guide Documentation
Illumina Stranded mRNA Prep Ligation Consumables & Equipment Documentation
自定义协议选择器
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全部 Illumina DNA RNA UD Indexes Support 全部 Illumina Stranded mRNA Prep Ligation Support