提高HiSeq 3000/4000/X5/X10 patterned flow cells簇通过率(passing filter)和产量的最佳操作

05/11/20


通过以下最佳操作确保簇生成反应在patterned flow cells上成功进行

若在patterned flow cells上簇生成没有达到应有效率,可能会影响HiSeq测序仪器照相时对焦的错误,read1的信号强度低, 产生不寻常的%base曲线, 以及低的passing filter rate

• 在文库变性和进行ExAmp反应前,先完成cBot的清洗,确保cBot试剂板完全融化,之后将Flow Cell和manifold放到cBot上。

• 待EPX1,EPX2和EPX3试剂融化后,将每管分别上下颠倒5次,然后短离心使试剂集中到管底。一定不要震荡EPX试剂或其反应混合物。

• EPX试剂较为粘稠,吸取和打出请将速度放慢,以保证取量精确。

• 按照顺序混合EPX试剂(先加EPX1,次加EPX2,最后加EPX3),加好后将含有EPX试剂混合物的离心管放到实验室的rotator上室温旋转5分钟以保证试剂充分混匀。

• 立即将EPX混合物加到变性后的模板排管中,然后轻轻敲打排管外壁以去除管内的气泡。

• 立即开始cBot run。

更多与patterned flow cells上进行簇生成和测序相关的详细信息请参考下面链接:

cBot System Guide

HiSeq X System Guide

HiSeq 3000 System Guide

HiSeq 4000 System Guide