07/15/2022
Illumina平台和测序试剂盒支持多种 测序应用. 为了保证最高水平的测序质量，Illumina根据测序平台和SBS试剂盒版本支持最长特定的读长，请参阅“ 我所购买的SBS试剂盒最多能够满足多少个循环的测序？ 技术文档。在本地运行管理软件（ Local Run Manager，LRM）或仪器控制软件（Control Software）运行设置期间，可以选择更长的读长。但是当read长度超过支持的长度，Illumina将无法保证较高的数据质量。
表 1. 测序平台和SBS试剂盒支持的最大读长
| 测序平台 | SBS 试剂盒版本 | 最大读长 |
|---|---|---|
| iSeq 100 | v1 | 2 x 151bp |
| v2 | 2 x 151bp | |
| MiniSeq | MO* | 2 x 151bp |
| HO* | 2 x 151bp | |
| MiSeq | v2 | 2 x 251bp |
| v3 | 2 x 301bp | |
| NextSeq 500/550 | MO* | 2 x 151bp |
| HO* | 2 x 151bp | |
| NextSeq 1000/2000 | P1, P2 | 2 x 301bp |
| P3 | 2 x 151bp | |
| HiSeq 1000/1500/2000/2500 | HO* v3 | 2 x 101bp |
| HO* v4 | 2 x 126bp | |
| RR** v4 | 2 x 251bp | |
| HiSeq 3000/4000 | N/A | 2 x 151bp |
| HiSeq X | N/A | 2 x 151bp |
| NovaSeq 6000 | SP | 2 x 251bp |
| S1, S2, S4 | 2 x 151bp | |
| NovaSeq X/X Plus | 10B | 2 x 151bp |
* MO: 中通量 / HO: 高通量
** 快速试剂盒
Index Reads的最大读长
表 2. 测序平台的最大单个Index长度
| 测序平台 | 单端或双端Index(最大读长) |
|---|---|
| iSeq 100 | 软件不限制 |
| MiniSeq v1.X | 20 bp |
| MiniSeq v2.X | 20 bp |
| MiSeq < v4 | 软件不限制 |
| MiSeq ≥ v4 | 100 bp** |
| NextSeq 500/550 v2 NCS | 20 bp |
| NextSeq 500/550 v4 NCS | 20 bp |
| NextSeq 1000/2000* | 软件不限制 |
| HiSeq 2500 | 软件不限制 |
| HiSeq 3000/4000 | 软件不限制 |
| HiSeq X | 单端Index为 6 bp / 双端Index为 2 x 8 bp |
| NovaSeq 6000 < v1.6.0 | 20 bp |
| NovaSeq 6000 ≥ v1.6.0 | 软件不限制 |
| NovaSeq X/X Plus v1.0 | 10 bp*** |
| NovaSeq X/X Plus v1.1 | 本地设置运行为10bp***/云端设置运行为12bp*** |
*在云模式下设置运行时，Index长度限制在10 bp以内。
**对于20-100 bp之间的Index读长，请使用手动上机模式，因为LRM v3的Index读长限制在20 bp以内。
***在手动设置运行且不进行分析时，Index长度没有限制