Illumina DNA Prep with Enrichment(原Nextera Flex for Enrichment)第三方panel要求

10/01/2022


Illumina DNA Prep with Enrichment(原Nextera Flex for Enrichment)是一个靶向富集流程,Illumina和第三方富集panels均可兼容。

第三方DNA探针Panel要求

如果将第三方带有生物素标记的DNA探针panels用于Illumina DNA Prep with Enrichment流程,富集panels需要满足以下标准:

  • 探针长度为80 bp或120 bp
  • 500到675,000个探针
  • 单链或双链DNA探针
  • 单个样本到12个样本混合后进行富集,探针总投入量≥ 3 pmol

使用DNA探针进行靶向富集时,参考 Illumina DNA Prep with Enrichment参考指南 。

第三方RNA探针Panel要求

如果将第三方带有生物素标记的RNA探针panels用于Illumina DNA Prep with Enrichment流程,富集panels需要满足以下标准:

  • 探针长度为120 nt
  • 300,000到675,000个探针
  • 单链探针
  • 单个样本到12个样本混合后进行富集,探针总投入量≥ 3 pmol

使用RNA探针进行靶向富集时,参考 Nextera Flex for Enrichment RNA探针示范Protocol .

将第三方探针panels用于Illumina DNA Prep with Enrichment可能需要额外的优化和验证,因为第三方探针panel尚未经过Illumina的验证。